Un supercalculateur révèle les faiblesses du VIH

Frontera a contribué à la création des premiers modèles réalistes de la capside du VIH-1 ainsi que des protéines, de l’eau, des protéines génétiques et des protéines.

Matériel. 

Modèle de capside

"Nous avons pu trouver une vulnérabilité dans la capside du virus VIH-1 grâce aux simulations et analyses à grande échelle que nous avons effectuées", a déclaré Gregory Wath, professeur émérite à l'Université de Chicago.

Les chercheurs ont utilisé les données expérimentales et ont développé une simulation atomique complète de la dynamique moléculaire de la capside du VIH-1. La simulation consistait en 100 millions d'atomes.

L'image résultante montre des rainures, elles apparaissent dans le processus de contrainte et de déformation. Ils peuvent être utilisés pour comprendre où le réseau de protéines se contracte ou se dilate.

Emplacements des rainures dans la simulation

De telles recherches aident à créer des médicaments qui fonctionnent selon la stratégie et le fonctionnement optimauxsur les points faibles du virus. 

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