Un supercalculateur montre pourquoi les nouvelles variantes de coronavirus sont plus contagieuses et mortelles

Tous les virus mutent en se copiant pour se propager. Le SRAS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19, n'est pas

est devenu une exception. Il existe désormais plus de 4 000 variantes du COVID-19, qui a déjà tué plus de 2,7 millions de personnes dans le monde pendant la pandémie.

Variante britannique, également connue sous le nom de B.1.1.7, découvert pour la première fois en septembre 2020 et causant désormais 98% de tous les cas de COVID-19 au Royaume-Uni. Il s'est également répandu dans une centaine d'autres pays, dont la France, le Danemark et les États-Unis.

L'Organisation mondiale de la santé ditque B.1.1.7 est l'une des nombreuses options préoccupantes, avec d'autres, émergeant en Afrique du Sud et au Brésil. «Les variantes du virus au Royaume-Uni, en Afrique du Sud et au Brésil sont plus infectieuses et plus faciles à se débarrasser de l'immunité que le virus d'origine», explique Victor Padilla-Sanchez, chercheur à l'Université catholique d'Amérique. «Nous devons comprendre pourquoi ils sont plus contagieux et dans de nombreux cas plus meurtriers.

Les trois variantes ont subi des changements dans leur protéine de pointe - la partie du virus qui se fixe aux cellules humaines. En conséquence, ils infectent mieux les cellules et se propagent.

Dans un article de recherche pour la revue ResearchIdées et résultats Padilla-Sánchez discute en détail des variantes britannique et sud-africaine. Il présente une analyse informatique de la structure de la glycoprotéine de pointe associée au récepteur ACE2 qui a muté. Son article expose la raison pour laquelle ces variantes se lient mieux aux cellules humaines.

«J'ai analysé la structure récemment publiéeSpike SARS-CoV-2, lié au récepteur ACE2, et a découvert pourquoi les nouvelles variantes sont plus transmissibles6, a-t-il déclaré. "Ces résultats ont été obtenus en utilisant le logiciel Chimera d'UC San Francisco et des simulations de dynamique moléculaire en utilisant le supercalculateur Frontera du Texas Advanced Computing Center (TACC)."

Padilla-Sanchez a découvert que la variante britanniquea de nombreuses mutations dans la glycoprotéine de pointe. Mais le plus important est une mutation, N501Y, dans le domaine de liaison au récepteur qui interagit avec le récepteur ACE2.

«La mutation N501Y offre uneefficacité de liaison, qui à son tour rend le virus plus infectieux. Cette option est dominée par le Royaume-Uni et s'étend à d'autres pays du monde », a-t-il déclaré.

Une variante sud-africaine du coronavirus est apparue dansOctobre 2020 et a des changements plus importants dans l'écureuil à pointes. Cela le rend plus dangereux que la version britannique. Il comprend la mutation clé E484K. Il aide le virus à échapper aux anticorps et aux parties du système immunitaire qui pourraient combattre le coronavirus, sur la base de l'expérience d'une infection ou d'un vaccin antérieur. En conséquence, le corps ne peut pas combattre le virus.

Padilla-Sánchez a effectué une analyse structurelle en examinantstructure cristalline du virus. Selon lui, les vaccins actuels ne seront pas forcément efficaces contre les variants britannique et sud-africain. « Ils auront besoin de leurs propres vaccins. Nous aurons besoin d’autant de vaccins qu’il y a de variants », conclut le scientifique.

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