Comment le coronavirus peut-il pénétrer dans le génome humain?
Selon le portail de biologie bioRxiv, des chercheurs de
Pour tester si le génome à ARN du SRAS-CoV-2 peutintégrer dans l'ADN de nos chromosomes, les scientifiques ont ajouté le gène de la transcriptase inverse (RT) - — qui convertit l'ARN en ADN dans les cellules humaines et a cultivé les cellules modifiées avec le SRAS-CoV-2.
Dans l'une des expériences, les scientifiques ont utilisé le gènetranscriptase inverse du VIH. Ils ont également fourni un gène de transcriptase inverse utilisant des séquences d’ADN humain connues sous le nom d’éléments LINE-1, qui sont des vestiges d’anciennes infections rétrovirales.
En conséquence, les cellules qui produisent toute forme d'enzyme ont fait en sorte que certains fragments d'ARN du SRAS-CoV-2 ont été convertis en ADN et intégrés dans les chromosomes humains.
Les auteurs de l'expérience estiment:malgré le fait que le travail a été effectué dans des conditions de laboratoire, les mêmes processus peuvent être déclenchés dans le corps humain lorsqu'il est infecté par un nouveau coronavirus. Le groupe à risque est principalement les patients VIH.
Qu'est ce que cela signifie?
En pratique, cela peut conduire àdes tests faussement positifs, qui montreront comme «malade» une personne qui a déjà été malade et n'est plus contagieuse. Les autres conséquences de cette modification génétique de l'homme ne sont pas encore connues.
Éléments du SRAS-CoV-2, intégrés dans l'humainL'ADN est susceptible de devenir des fragments sous-génomiques. En d'autres termes, on ne parle plus d'un virus à part entière, mais de ses traces dans l'ADN. C'est peut-être à cause d'eux que chez ceux qui se sont rétablis du COVID-19, l'analyse PCR donne souvent un résultat positif même après la guérison.
De plus, la question reste ouverte:si le SRAS-CoV-2 est capable de se reproduire en étant incorporé dans l'ADN - comme, par exemple, le VIH. Les auteurs eux-mêmes estiment que la probabilité est faible: après l'intégration de fragments d'ARN dans le génome, la reproduction d'un nouveau virus est impossible. Cela signifie que ceux qui se sont rétablis de la maladie, malgré les tests positifs, ne sont plus contagieux.
Y a-t-il d'autres opinions sur cette étude?
Les experts ont souligné le manque de données etle fait que les conditions de laboratoire sont très différentes de celles d'un organisme vivant. De plus, la probabilité d'intégrer l'ARN viral dans le génome à l'aide d'éléments LINE-1 est extrêmement faible - ils montrent rarement une activité dans l'ADN humain.
Marius Walter, biologiste moléculaire de l'InstitutLa recherche sur le vieillissement Baca (États-Unis) a appelé sur Twitter l'administration du portail bioRxiv à supprimer la publication car elle contient des déclarations dangereuses et non fondées.
À son avis, il n'y a aucune preuve claire quedes fragments d'ADN humain, similaires aux éléments du SRAS-CoV-2, sont apparus à la suite de la transcription inverse de l'ARN viral. Il y a d'autres explications à cela, plus plausibles, a-t-il noté.
Avec tout le respect que je dois aux auteurs, je pense que c'est un article extrêmement médiocre. La bonne nouvelle, c'est que je pense aussi qu'il est en fait très facile de réfuter cette affirmation. Quelques réflexions ci-dessoushttps://t.co/0ITkKJin1b
— Marius Walter (@mw_fr) 14 décembre 2020
Néanmoins, David Baltimore, un biochimiste américain qui a reçu un prix Nobel pour la découverte de la transcriptase inverse, a qualifié le travail d'« impressionnant et inattendu » dans les pages du magazine Science.
Il a cependant précisé :les auteurs viennent de montrer que des fragments du SARS-CoV-2 sont, en principe, capables de s'intégrer dans le génome. Apparemment, le virus, s'étant intégré dans les chromosomes, cesse de se reproduire, et d'un point de vue biologique, c'est la mort pour lui, a souligné le chercheur.
De plus, il n'est pas encore clair si les cellules du corps humain où le processus de transcription inverse a eu lieu meurent ou continuent de vivre.
Sinon, comment le coronavirus nous affecte-t-il?
- L'évolution du coronavirus dépend des gènes
Début décembre, la revue Nature publiait un articlesur les résultats d’une étude sur l’influence des gènes sur la gravité du coronavirus. Les scientifiques ont étudié l’ADN de patients de près de 200 unités de soins intensifs d’hôpitaux britanniques chez lesquels il a été confirmé qu’ils étaient porteurs du coronavirus. Les génomes des personnes admises en soins intensifs ont ensuite été comparés à ceux de personnes en bonne santé pour identifier d’éventuelles différences.
L'étude a montré que pour un cours sévèrele coronavirus peut être affecté par le gène TYK2 s'il présente un défaut. Des différences ont également été trouvées dans le gène DPP9, qui joue un rôle important dans l'inflammation, et dans le gène OAS, qui empêche la réplication virale.
- Plus de 100 protéines humaines interagissent avec l'ARN du coronavirus
Des biologistes moléculaires allemands ont étudié en détail comment l'ARN du nouveau type de coronavirus interagit avec le contenu des cellules humaines.
Des scientifiques allemands ont isolé plusieurs gènes etvariations de l'ADN, en raison desquelles la probabilité de complications du COVID-19 ou de décès potentiel augmente de 2 à 3 fois. Certains d'entre eux sont responsables de la suppression des infections, d'autres jouent un rôle important dans le cycle de reproduction du virus lui-même. Ils sont responsables de la collecte des enzymes qu'il utilise pour faire de nouvelles copies de lui-même.
Afin de comprendre cela, les chercheurs ont compilé une liste de protéines qui interagissent d'une manière ou d'une autre avec les particules de SRAS-CoV-2 lorsqu'elles pénètrent dans les cellules humaines.
En conséquence, il s'est avéré que le coronavirus est à sens unique ousinon interagit avec 104 peptides humains. L'analyse a montré que vingt d'entre eux peuvent supprimer ou développer une infection. Certains d'entre eux, tels que EIF4F et EIF4B, étaient déjà connus des scientifiques lors d'expériences précédentes.
- La gravité de la maladie dépend de la quantité d'ARN de coronavirus dans le sang
Des chercheurs de l'Université Toyama et de l'Institut de santé publique Toyama ont trouvé une corrélation directe entre la quantité d'ARN du virus SRAS-CoV-2 dans le sang d'un patient et la gravité du COVID-19.
Pour tester cette idée, ils ont menéUne étude rétrospective de 56 patients admis avec COVID-19 dans plusieurs centres au Japon entre le 13 avril et le 28 septembre 2020. Les chercheurs ont comparé les tests d'ARN viral dans leur sang avec des tests PCR du nasopharynx prélevés dans les sept jours suivant l'échantillon de sérum.
Les résultats de l'étude ont montré queChez les patients critiques, l'émission d'ARN a été observée dans 100% des cas, chez les patients sévères - dans la moitié, chez les patients modérés - dans 4% des cas, et chez les patients légers et asymptomatiques, ce n'était pas du tout.
En conséquence, l'hypothèse des auteurs de l'étude a été confirmée : la gravité de la maladie peut être jugée par la quantité d'ARN viral dans le sang.
- Des troubles mentaux se développent chez 20% des patients après un coronavirus
Des scientifiques britanniques ont remarqué que 20%les patients qui se sont rétablis d'un coronavirus courent un risque accru de développer des troubles mentaux. Ils notent que cette tendance est associée au stress et aux effets physiques de la maladie.
Dans une étude publiée dans TheLancet Psychiatry a analysé les dossiers médicaux électroniques de 69 millions de personnes aux États-Unis, parmi lesquels 62000 patients avaient un coronavirus. Le pourcentage de troubles mentaux chez ces derniers était plus élevé, et ils se sont développés dans les trois mois suivant la guérison.
Dans les trois mois suivant un test positifpour le coronavirus, un sujet sur cinq a trouvé les premiers signes d'anxiété, de dépression ou d'insomnie. C'était environ deux fois plus probable que dans d'autres groupes de patients au cours de la même période.
Les professionnels de la santé mentale nonles participants à l'étude ont déclaré que ces résultats pourraient indiquer que le coronavirus peut affecter le cerveau humain, augmentant le risque de développer plusieurs maladies mentales.
Conséquences à long terme
- Fatigue constante
Une enquête récente menée auprès d'un groupe de soutien pour les personnes souffrant des effets de l'infection à coronavirus a montré que la fatigue était le plus courant des 50 principaux symptômes ressentis par les personnes souffrant des effets de l'infection à coronavirus.
- Problèmes de sommeil
Malgré la plus forte faiblesse, les personnespostkovidom se plaignent souvent d'insomnie. Il peut être difficile pour eux de s'endormir. Mais même si cela réussit, après 2-3 heures, de nombreuses personnes se réveillent soudainement et ne peuvent plus se rendormir.
- Problèmes cardiaques et vasculaires
La recherche montre que le coronavirus est infectéendothélium - la couche de cellules qui tapisse la surface interne des vaisseaux sanguins. Cela conduit à une inflammation, une douleur dans les vaisseaux sanguins (ressentie en particulier sur les mains ou les pieds), l'apparition d'une éruption cutanée rouge - "toile d'araignée", visible à travers la peau.
- Lésions rénales
Une insuffisance rénale a été observée chez environ un patient sur sept atteints de COVID-19 sévère.
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