Première souche indienne
Delta (B.1.617.2) est une nouvelle variante du coronavirus SARS-CoV-2, découverte pour la première fois et
Le 16 juin 2021, Medvestnik a rapporté que l'actionLa souche indienne delta (B.1.617 selon la classification Pango) représentait 63,2% en Russie au cours des quatre dernières semaines, comme l'indique la plateforme internationale GISAID, qui offre un accès libre aux séquences génomiques des virus de la grippe et du coronavirus et aux données géographiques sur la répartition des variantes du coronavirus.
Dans la base de données des projets de Berne et BâleLes universités suisses CoVariants ont indiqué que la part de la souche indienne delta provenant d'échantillons séquencés était de 66 % en Russie dans la seconde quinzaine de mai 2021.
Selon le Consortium russe pourséquençage des génomes du SRAS-CoV-2 (Coronavirus Russian Genetic Initiative, CoRGI), le variant delta indien représentait un peu plus de la moitié (52 %) des échantillons obtenus en mai, et plus de 90 % en juin 2021.
Deuxième souche indienne
Le 14 juin 2021, l'Inde a été découverteune variante mutée de B.1.617.2, connue sous le nom de variante AY.1 ou delta +. Delta + se distingue par la présence de la mutation K417N dans la protéine de pointe, qui peut réduire l'activité des anticorps chez les personnes guéries et vaccinées.
Le ministère de la Santé ne la classe pas encore comme une mutation préoccupante. Il est nommé "Delta Plus" car il utilise huit mutations de protéines de pointe, alors que le "virus delta" habituel n'en utilise que six.
Les responsables du gouvernement de l'État ont déclaré que davantage d'échantillons du virus avaient été envoyés pour le séquençage du génome, avec des plans pour savoir si la nouvelle variante est dominante.
Pour contenir la propagation du coronavirus, les autorités ont créé des zones spéciales et des zones scellées où une nouvelle variante du coronavirus a été découverte.
D'où viennent les deux souches ?
La variante delta a été découverte pour la première fois en Indel'automne dernier, le premier génome a été publié dans la base de données internationale GISAID le 7 octobre 2020. Cela ne signifie toutefois pas que la nouvelle variante du SRAS-CoV-2 est originaire du même pays : la souche n'a été découverte qu'en Inde.
Les premiers cas d'infection delta + ont été signalés dans quatre districts de l'État du Maharashtra, dans le centre de l'Inde
Pourquoi les souches indiennes sont-elles dangereuses ?
La première souche indienne présente de nombreuses mutations.On sait désormais que la variante delta est six fois plus contagieuse que les souches de Wuhan, du Royaume-Uni, de l’Afrique du Sud et du Brésil. Elle a provoqué une épidémie record en Inde ce printemps et se propage désormais dans de nombreux pays, éliminant d'autres souches.
Selon GISAID, les leaders en nombre de souches indiennes échantillonnées sont la Grande-Bretagne, les États-Unis, l'Allemagne, Singapour, le Canada et la Russie.
La caractéristique delta de la variante est notéemutation P681R dans la région dite « d’insertion de furine » commune à tous les variants. Cet insert est un petit fragment de la protéine S dans lequel il peut être coupé avant d'entrer dans la cellule.
Partisans de l'origine laboratoire du SRAS-CoV-2considérons cette insertion comme l’un des arguments en faveur du fait que le virus a été artificiellement « amélioré » par des chercheurs qui cherchaient à le rendre plus infectieux pour les cellules humaines.
Le raisonnement était basé sur le fait que cette furinel'insert n'est pas présent chez les plus proches parents du SARS-CoV-2, mais en même temps il facilite la coupure de la protéine S et affecte l'infectiosité (un site similaire, cependant, se trouve dans d'autres coronavirus).
La principale chose qui distingue l’option delta de delta+ est—mutation K417N. Il s'agit d'une mutation du gène de la protéine Spike qui conduit au remplacement de l'acide aminé lysine (K) par l'acide aminé asparagine (N) de cette protéine en position 417, qui est située dans ce qu'on appelle le domaine de liaison au récepteur ( RBD), qui est responsable de la liaison du virion aux récepteurs à la surface des cellules humaines, a déclaré Konstantin Krutovsky, professeur au Département de génomique et de bioinformatique de l'Université fédérale de Sibérie et professeur à l'Université de Göttingen.
Dans quelle mesure les souches se sont-elles propagées à travers la Russie?
- Delta
En Russie, selon le consortium russe ouvert pour le séquençage des génomes du SRAS-CoV-2, en mai, Delta représentait un peu plus de la moitié de tous les cas (52 %) et en juin, plus de 90 %.
Ces données, cependant, ont été obtenues à la suite derecherche uniquement à Saint-Pétersbourg. La diffusion croissante de Delta en Russie est également attestée par les données de la veille internationale du portail Nextstrain.org :
Analyste de données Sergey Shpilkin basé sur des donnéesGISAID, qui étudie les génomes des virus, a calculé que la proportion de la souche indienne en Russie double tous les 5 à 6 jours. « Sans prendre de mesures supplémentaires, nous aurons un doublement du nombre de cas dans ces mêmes 5-6 jours.
- Delta +
Selon les médias indiens, 36 échantillons,contenant le génome Delta Plus ont été trouvés en Angleterre. D'autres cas ont été liés à des voyages au Népal, en Turquie, en Malaisie et à Singapour. En outre, certains échantillons provenaient d’Europe et d’Amérique, ce qui indique la prévalence généralisée de cette variante. Aucun cas d'infection delta+ n'a été signalé en Russie pour le moment.
Différences dans les symptômes
La souche indienne du coronavirus est complètement différentesymptômes. Au Royaume-Uni, où la souche Delta est devenue dominante, les patients se plaignent désormais le plus souvent de maux de tête, de maux de gorge, de fièvre et d'écoulement nasal.
Les symptômes du covid classique sont la perte de l'odorat etles toux sèches sont désormais beaucoup moins courantes, ce qui rend le coronavirus facile à confondre avec un rhume ou une grippe ordinaire, écrit The Mirror, citant des scientifiques du King's College de Londres.
La source des discussions selon lesquelles l'infectionla variante delta entraîne des symptômes légèrement différents de ceux de l'infection par d'autres variantes du SRAS-CoV-2, semble être devenu Tim Specter, un employé du King's College de Londres. Les propos de Specter n'ont cependant pas encore été confirmés ni par des publications scientifiques ni même par des symptômes. Communiqué de presse du projet de suivi.
Rospotrebnadzor a déclaré que lorsqu'il est infectéavec la souche Delta, les patients se plaignent de douleurs abdominales et articulaires, de nausées et de perte d'appétit et d'audition. Les experts citent des données de médecins indiens : en Inde, les patients ont souvent la diarrhée, tandis que la fièvre, la toux et la perte d'odorat sont moins fréquentes.
Les vaccins contre les souches indiennes fonctionnent-ils ?
La variante delta est également capable de s'échapper partiellementl'immunité naturelle et vaccinale, qui se manifeste, par exemple, par le fait qu'une seule vaccination pour une protection fiable dans son cas ne suffit pas, elle n'a lieu qu'après l'administration de la deuxième dose.
Les personnes entièrement immunisées sont encoreprotégé de l'évolution sévère de la maladie, bien qu'une légère diminution de l'efficacité (par rapport à l'apparition des symptômes) soit observée dans les statistiques pour ces personnes.
L'OMS exhorte à attendre les résultats de plusétudes détaillées - jusqu'à présent, il n'y a aucune preuve que les vaccins ne fonctionnent pas. Cependant, des scientifiques russes ont déclaré le 18 juin que de nouvelles mutations dans le coronavirus réduisaient l'efficacité des vaccins développés et testés contre des souches antérieures.
Le chef de BioNTech Ugur Sakhin en avril a égalements'est dit confiant dans l'efficacité du vaccin Pfizer contre la souche indienne. Cependant, CNBC note qu'à cette époque, la société ne disposait pas de données suffisantes sur l'option delta.
Selon des scientifiques indiens, delta+ échappe au traitement par anticorps monoclonaux contre le COVID-19. Mais cela reste encore à prouver.
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