Stvoren je do danas najkompletniji atlas genoma koronavirusa

Tim predvođen znanstvenicom RNA Anne Marie Pyle sastavio je najopsežniju kartu do sada

genomske strukture koronavirusa. Znanstvenici su mapirali strukture cijelog RNA genoma SARS-CoV-2 koristeći se živim stanicama i računalnom analizom.

SARS-CoV-2 oslanja se na svoj jedinstveniRNA strukture zaraziti ljude i uzrokovati bolest COVID-19. No, doprinos ovih struktura infekcijama i bolestima često potcjenjuju čak i znanstvenici, kaže Pyle, istraživač s medicinskog instituta Howard Hughes na sveučilištu Yale.

Po svemu sudeći, ako se samo usredotočimona proteinima kodiranim u genomu virusa, razumjet ćemo kako SARS-CoV-2 djeluje. No za ove vrste virusa, RNA strukture u genomu mogu utjecati na njihovu sposobnost funkcioniranja u istoj mjeri kao i kodirani proteini.

Anna Marie Pyle, istraživačica na Medicinskom institutu Howard Hughes na Sveučilištu Yale

Istraživači sada mogu početi shvaćati kakote strukture pomažu virusu. Ove bi informacije u konačnici mogle dovesti do novih tretmana za COVID-19. Na primjer, nakon što su znanstvenici identificirali strukture RNK koje izvode ključne zadatke, bit će moguće smisliti načine kako ih poremetiti i spriječiti infekciju.

Genom SARS-CoV-2, broji oko 30.000 slovaRNA neobično duga za RNA virus. Pretvaranje njegove RNK u trodimenzionalni oblik daje SARS-CoV-2 još jedan skup alata za kompenzaciju ograničenog broja gena. "RNA virus ima najveću korist u smislu načina na koji koristi svoj genom", kaže Pyle.

Elektronsko skeniranje u bojimikrofotografija stanice (plavo) jako zaražene virusnim česticama SARS-CoV-2 (crveno), izolirane iz uzorka pacijenta. Fotografija snimljena u NIAID Integrated Research Facility (IRF) u Fort Detricku, Maryland.
Zasluge: NIAID

Prema Jeffreyju Keeftu, StructuralRNA biolog i virolog sa Sveučilišta Colorado, znanstvenicima je potrebna karta za njegov genomski krajolik za proučavanje bilo kojeg RNA virusa, posebno SARS-CoV-2. "Doktor Pyle je stvorio neku vrstu globalnog atlasa koji je izvrsno polazište za sljedeću rundu ciljanijih eksperimenata", kaže on. “Ovo istraživanje na mnogo načina grebe površinu bogatosti strukture RNK koja vjerojatno postoji u ovom virusu. Pretpostavljam da nas čekaju mnoga iznenađenja. "

Mapiranje također predstavljapreliminarni korak prema novim lijekovima koji mogu ciljati RNA strukture virusa. Međutim, putovanje može biti dugo. Od 2014. godine, kada je njegov laboratorij otkrio nodularnu strukturu koju virusi denga i Zapadnog Nila koriste za zaobilaženje stanične obrane, Kieft pokušava pronaći način kako ju neutralizirati. Upozorava da istraživačka zajednica nije u potpunosti predana identifikaciji lijekova koji narušavaju strukturu RNK. "Ova strategija nije proučavana i primijenjena na isti način kao i za proteine", kaže on. Međutim, kada se bavite pandemijskim virusom poput SARS-CoV-2, "pokušavate sve".

Pročitajte i

Halo Andromede približava se našoj galaksiji. Kažemo vam zašto je to važno

Simptomi koronavirusa kod djece. Na što treba obratiti pažnju?

Pokazalo se da je civilizacija Maja napustila njihove gradove