Razvijena je nova metoda za otkrivanje alfa varijante SARS-CoV-2 u otpadnim vodama

Znanstvenici iz interdisciplinarne istraživačke grupe za antimikrobnu rezistenciju (AMR) u

Lokacija u Singapuru sa zaposlenicima iz BiobotaAnalytics, Tehnološko sveučilište Nanyang (NTU) i MIT uspješno su razvili inovativnu metodu za molekularno traženje B.1.1.7 (Alpha) varijante SARS-CoV-2.  Omogućit će brzo i jeftino praćenje drugih varijanti novog tipa koronavirusa u otpadnim vodama.

Praćenje otpadnih voda pomaže brzo inenametljivo prati širenje COVID-19. Dodatne informacije zdravstvenim vlastima omogućuju praćenje pandemije na razini zajednice. U novije vrijeme, fragmenti virusa SARS-CoV-2 pronađeni su u stambenim područjima u Singapuru kao dio proaktivnog programa nadzora otpadnih voda. Ove su informacije, zajedno s naknadnim testiranjem, omogućile Ministarstvu zdravstva zemlje da brzo odgovori na situaciju.

Međutim, otkrivanje varijanti koronavirusa spraćenje otpadnih voda rjeđe je zbog problema s postojećim tehnologijama. Sljedeće generacije za praćenje otpadnih voda dugotrajno su i skupe. Testovi također nemaju osjetljivost. Međunarodni tim znanstvenika u novoj studiji nastojao se pozabaviti ovim problemom.

U studiji objavljenoj učasopis Environmental Science & Technology Letters, znanstvenici objašnjavaju inovativnu metodu molekularne detekcije koja se temelji na alel-specifičnom RT-qPCR-u koji detektira i kvantificira varijantu B.1.1.7 (Alpha). Razvijeni test, testiran i potvrđen na uzorcima otpadnih voda iz 19 američkih zajednica, sposoban je pouzdano otkriti i kvantificirati niske razine varijante B.1.1.7 (Alpha) s niskom unakrsnom reaktivnošću i udjelima varijanti od samo 1 posto u miješanoj Pozadine virusa SARS-a -CoV-2.

Metoda usmjerena na mutacije šiljaka proteina koja predviđa varijantu B.1.1.7 (Alfa) može se provesti korištenjem komercijalno dostupnih RT-qPCR protokola.

Čitaj više

Usporavanje rotacije Zemlje uzrokovalo je oslobađanje kisika na planeti

Astronomi primjećuju neobične strukture u svemiru

Pogledajte više 60.000 godina stare neandertalske rock umjetnosti

AMR - Antimikrobna rezistencija

RT -qPCR - kvantitativna PCR reverzna transkripcija.