AI pomaže prepoznati ostatke RNA drevnih virusa u ljudskom genomu

Prethodne studije pokazale su da kada virus uđe u ljudsko (i drugo životinjsko) tijelo, on

 može promijeniti DNK domaćina dodavanjem dijelasvoju vlastitu RNK. Također je poznato da su drevni virusi koji su zarazili stanovništvo prije mnogo godina ponekad ostavljali ostatke svoje RNK u ljudskom genomu. Međutim, pokazalo se da je njihovo pronalaženje težak zadatak zbog ogromnog broja usporedbi potrebnih za svaki "sumnjivi" virus. U novom radu istraživači su koristili algoritam strojnog učenja kako bi riješili problem.

Da bi trenirali algoritam, znanstvenici su koristili RNA izpoznati neretrovirusni endogeni RNA virusni elementi. Obučavajući algoritam moderne virusne RNA, sustav bi mogao steći dojam kako izgleda u cjelini. Istraživači vjeruju da su takve sličnosti vjerojatno postojale i u drevnoj RNA. Nakon treninga, znanstvenici su doradili sustav kako bi spriječili što više lažnih pozitivnih rezultata. Zatim su ga pregazili na ljudskom genomu i pronašli stotinjak mogućnosti za daljnje razmatranje. Nakon njihovog ispitivanja, istraživači su otkrili da su mnogi od njih već poznati, a neki ispod praga koji su postavili kao opciju prolaska / neuspjeha. Preostao im je samo još jedan mogući ostatak nepoznatog virusa.

Kasnije su znanstvenici provjerili jesu li pronašli istorezidualna virusna RNA u genomima drugih vrsta, poput majmuna i čimpanzi. Ovo otkriće sugerira da su se infekcija i daljnje promjene DNK dogodile prije najmanje 43 milijuna godina.

Istraživači su primijetili da će više informacija o drevnim virusima i njihovom utjecaju na ljudski genom pružiti uvid u nijanse ponašanja suvremenih virusa koje su još uvijek nepoznate.

Čitaj više

Pobačaj i znanost: što će se dogoditi s djecom koja će roditi

Radari su pronašli posljednju utvrdu Tlingit na Aljasci. Tražili su ga više od 100 godina

Trećina onih koji su se oporavili od COVID-19 vraća se u bolnicu. Svaki osmi - umire