Do danas je novi tip koronavirusa uzrokovao 3,9 milijuna smrti diljem svijeta. Na početku pandemije
Istraživač iz Seattlea otkrio je izbrisane datoteke s Google Clouda koje otkrivaju 13 djelomičnih genetskih nizova iz nekih od najranijih slučajeva COVID-19 u Wuhanu.
Sekvence ne mijenjaju ravnotežuiz ili iz mnogih teorija o tome kako je SARS-CoV-2 nastao. Na primjer, ne podržavaju teoriju da je virus procurio iz visoko sigurnosnog laboratorija u Wuhanu. Ipak, dokazi upućuju na to da je novi koronavirus kružio čak i prije nego što je otkrivena prva velika epidemija na tržnici plodova mora u kineskoj provinciji.
Točno odrediti kako i gdje se dogodilovirusa, znanstvenici trebaju pronaći takozvani prekursorski virus iz kojeg potječu svi drugi sojevi. Do sada su najraniji slijedovi uglavnom uzeti iz slučajeva na tržnici morskih plodova Huanan u Wuhanu. Prvotno se nagađalo da se SARS-CoV-2 prvi put pojavio krajem prosinca 2019. Međutim, slučajevi od početka prosinca do studenog te godine nisu imali tržišnu vezu. To ukazuje da je virus nastao s drugog mjesta.
Slučajevi pronađeni na tržištu uključuju trimutacije koje nedostaju u uzorcima virusa otkrivene tjednima kasnije izvan tržišta. Virusi bez mutacija bliže su odgovarali koronavirusima koji se nalaze u potkovičastim šišmišima. Znanstvenici su uvjereni da je novi koronavirus nekako potekao od šišmiša, pa je logično pretpostaviti da ni predak nije imao ove mutacije.
A sada Jesse Bloom s Medicinskog institutaHoward Hughes iz Seattlea otkrio je da su izbrisani podaci o sekvenci (vjerojatno neki iz najranijih uzoraka virusa) također lišeni ovih mutacija.
Prije otprilike godinu dana, 241 genetskisekvenca oboljelih od koronavirusa nestala je iz arhive za čitanje sekvence, internetske baze podataka koju vodi Nacionalni institut za zdravlje (NIH).
Bloom je primijetio nedostajuće sekvence,kada sam naišao na proračunsku tablicu u studiji objavljenoj u svibnju 2020. u PeerJ -u. Oni su bili dio projekta Sveučilišta Wuhan PRJNA612766 i navodno su učitani u arhivu. Znanstvenik je pretraživao arhivsku bazu podataka za sekvence i dobio poruku "Stavke nisu pronađene".
Njegova je istraga otkrila da su izbrisanisekvence prikuplja Sveučilišna bolnica Wuhan. Istodobno, preprint studije, objavljene na temelju ovih sekvenci, sugerira da su uzeti iz uzoraka brisa iz nosa iz ambulantnih pacijenata sa sumnjom na COVID-19 na početku epidemije.
Bloom nije uspio pronaći objašnjenje zašto su sekvence uklonjene, a na njegove e -poruke autorima studije nije odgovoreno.
Znanstvenik napominje da “nema uvjerljivog znanstvenograzlozi za brisanje podataka." Stvar je u tome da sekvence u potpunosti odgovaraju uzorcima opisanim u djelu. U dokumentu nema ispravaka. Dodatno, studija naglašava da su uzorci dobrovoljno dobiveni od pojedinaca, a sekvenciranje ne pokazuje dokaze o kontaminaciji plazmidom ili kontaminaciji uzoraka. "Čini se vjerojatnim da su sekvence uklonjene kako bi se prikrilo njihovo postojanje", zaključuje Bloom.
Članak s njegovim nalazima objavljen je na web stranici biorxiv preprint.
Čitaj više
Najveći komet u povijesti viđen je u Sunčevom sustavu: to je gotovo planet
Nova metoda trenutno pretvara ugljik u grafen ili dijamante
Pronašli smo jeftin način da spasimo središta megagrada od pregrijavanja