Smrtonosna evolucija: odakle dolaze nove inačice COVID-19 i koje su najopasnije

Kako se pojavljuju sojevi

Virusi se razmnožavaju samo unutar žive stanice, koristeći njezine resurse. Za ovo oni

trebate udvostručiti RNA.Ovo je složen proces u više koraka u kojem se pojavljuju pogreške. Najtipičnije su preraspodjele nukleotida, zamjena jednih drugim. To se naziva točkasta mutacija. Kada se RNA duplicira, male sekvence se mogu izgubiti ili, obrnuto, umetnuti.

U svijetu ne postoji općeprihvaćena nomenklaturanazivi sojeva i korišteni nazivi prilično su proizvoljni. U pravilu se sastoje od pojedinačnih slova i brojeva koji se pišu iza imena vrste. Na primjer, jedan od najpoznatijih sojeva E. coli jeE coliK−12.

Virus pokušava ispraviti neuspjehe replikacije, ali ne uvijek uspješno. Ako mutacija patogenu pruži bilo kakvu životnu prednost, može uzeti maha.

Kolonije soja bakterijaYersiniana površini agar-agara

Trenutno je poznato da SARS-CoV-2akumulira mutacije otprilike jednakom brzinom kao i uzročnik gripe. Mutacije u genomu nove vrste koronavirusa gotovo uvijek nastaju ne zbog slučajnih pogrešaka tijekom kopiranja, kao kod mnogih drugih virusa, već kao rezultat oštećenja ili nepravilnog uređivanja već gotove kopije RNA virusa.

Kako se pronalaze novi sojevi COVID-19

Uzorci sluznica uzimaju se od bolesnika idekodirati genom patogena. Te se informacije učitavaju u uobičajene baze podataka i uspoređuju. Na primjer, baza podataka GISAID sadrži više od dva milijuna genima koronavirusa iz cijelog svijeta. Postoji alat za praćenje koji vizualizira koja je opcija identificirana u kojoj je zemlji.

Do 16. siječnja Rospotrebnadzor je objavio da je smislio poseban test koji će identificirati britanski soj. Rezultat će pokazati 1,5 sata nakon što je osoba uzela bris.

Potrebni su dublji i složeniji testovireći kakvo opterećenje pacijent ima. Sada [pomoću PCR testova] možete saznati ima li osoba aktivan virus - postoji li određena varijanta COVID-19 ili ne. No, to ne znači da je uopće nemoguće odrediti konkretan soj, samo treba više vremena i novca. 

Alexey Agranovsky, profesor na Moskovskom državnom sveučilištu i doktor bioloških znanosti

Stoga, u Rusiji, saznajte koliko ljudizarazio koronavirusom s određenom mutacijom, još nije moguće, ali se može  nasumične testove kako bismo shvatili koliko je raširen određeni soj X. 

Na web mjestu CoVariants, koristeći GISAID podatke, možete vidjeti koje mutacije razlikuju genom dane varijante. Dakle, delta varijanta ima četiri značajne mutacije proteina klasova i dva brisanja.

Najopasnije varijante COVID-19

WHO je kao opasne klasificirao četiri varijante: alfa, beta, gama i delta. 

  • Alfa

Soj je prvi put otkriven u listopadu 2020. tijekom pandemije COVID-19 u Ujedinjenom Kraljevstvu iz uzorka prikupljenog prethodnog mjeseca.

Od tada su se njegove šanse za dominaciju udvostručilesvakih 6,5 dana (pretpostavljeni generacijski interval). To je u korelaciji sa značajnim porastom infekcija COVID-19 u Ujedinjenom Kraljevstvu. 

Postoje neki dokazi da ova varijanta ima 30% do 70% veću prenosivost, a preliminarne studije sugeriraju povećanu smrtnost. 

Međutim, kako se više događamutacije, cjepivo će možda trebati modificirati. SARS-CoV-2 ne mutira tako brzo kao virusi gripe, na primjer, a nova cjepiva koja su se pokazala učinkovitima do kraja 2020. vrste su koje se mogu modificirati ako je potrebno.

Od kraja 2020. tijelazdravstvo i stručnjaci iz Njemačke, Ujedinjenog Kraljevstva i Amerike vjeruju da će postojeća cjepiva biti jednako učinkovita protiv soja VOC-202012/01 kao i protiv prethodnih sojeva.

  • Beta

Kako je objavljeno, soj je prvi put otkriven u Južnoj Africiizvijestilo je južnoafričko Ministarstvo zdravstva 18. prosinca 2020. Istraživači i dužnosnici rekli su da je prevalencija ovog soja bila veća među mladim ljudima bez ikakvih temeljnih zdravstvenih tegoba, au usporedbi s drugim sojevima vjerojatnije je da će uzrokovati ozbiljne bolesti u tim slučajevima. 

Znanstvenici su primijetili da ovaj soj sadrži nekoliko mutacija koje mu omogućuju lakše vezivanje za ljudske stanice.

8. siječnja 2021. Guardian je objavio da je cjepivoPfizer i COVID-19 BioNTech pokazali su u testovima, uključujući 20 testova krvi, da je sposoban pružiti zaštitu protiv soja 501.V2. Potrebna su daljnja istraživanja kako bi se utvrdio točan stupanj zaštite.

Tvrtka Moderna najavila je 24. veljače 2021. početak kliničkih ispitivanja nove verzije svog cjepiva. Nova verzija posebno je dizajnirana za rad s 501.V2.

  • Gama

Soj je prvi put otkriven u Tokiju 6. siječnja 2021. godinegodine Nacionalni institut za zarazne bolesti (NIID). Novi soj otkriven je kod četiri osobe koje su u Tokio stigle iz države Amazonas 2. siječnja 2021. godine.

Novi se soj prvi put pojavio u srpnju i bio je prviotkriven u listopadu, ali u vrijeme objavljivanja (prosinac 2020.), iako se njegova učestalost znatno povećala, njegova je distribucija još uvijek bila uglavnom ograničena na glavni grad države Rio de Janeiro.

Novost je bila mutacija proteina šiljaka K417T, što dopuštavirus se čvršće veže za ljudske stanice, a u nekim slučajevima čak izbjegava antitijela. Uz to, virus jače zaražava mlade ljude i trudnice od izvornika.

11. veljače 2021., čelnik brazilskog Ministarstva zdravstva Eduardo Pazuello objavio je da je ovaj soj tri puta zarazniji od "izvornog" SARS-CoV-2.

  • Delta

U listopadu 2020. linija B.1.617.2 prvi je put otkrivena u Indiji. U drugoj polovici travnja 2021. soj indijske delte ušao je u Rusiju.

14. lipnja 2021. otkriven je u Indijimutiranu varijantu B.1.617.2, koja je poznata kao AY.1 ili "delta plus" varijanta. “Delta Plus” se razlikuje po prisutnosti mutacije K417N u proteinu šiljaka, koji može smanjiti aktivnost antitijela kod oporavljenih i cijepljenih ljudi.

Indijsko ministarstvo zdravstva imenovalo je tri karakteristične značajke"delta plus": povećana zaraznost, poboljšana sposobnost vezanja na receptore plućnih stanica i potencijalna otpornost na terapiju monoklonskim protutijelima. 

Do početka srpnja 2021. Svjetska organizacijaZdravstvo je zabilježilo delta soj u 98 zemalja s visokom i niskom razinom procijepljenosti stanovništva, a u mnogim zemljama postaje dominantan. 

Prema Ruskom konzorciju zaSekvenciranjem genoma SARS-CoV-2 (Coronavirus Russian Genetic Initiative, CoRGI), soj delta zauzimao je nešto više od polovine (52%) u uzorcima dobivenim u Sankt Peterburgu u svibnju 2021., a u lipnju 2021. - više od 90%.

Također, "delta plus", identificiran u lipnju prošle godine u Nepalu, spada u kategoriju prijetnji. Ima pet mutacija proteina klasja koji čine virus vrlo opasnim.

Koje mogućnosti promatraju znanstvenici COVID-19

Na popisu SZO-a postoje još četiri varijante SARS-CoV-2 koje su zanimljive, ali zasad nema razloga da ih smatramo opasnijima: Eta, Iota, Kappa, Lambda.

  • Lambda

Takozvani "lambda soj" SARS-CoV-2 po prvi putadodijeljena Peruu krajem prošlog ljeta. Infekcije novim sojem također su zabilježene u Argentini i Čileu. Poslije se proširio na Njemačku, Španjolsku, SAD, Veliku Britaniju i nekoliko drugih zemalja.

Genom "lambda soja" sadrži skup od osamključne mutacije za koje se vjeruje da povećavaju zaraznost virusa. Brazilski znanstvenici predvođeni Priscilom Wink sa Saveznog sveučilišta u Rio Grande do Sul prvi su put zabilježili tragove "lambda varijante" SARS-CoV-2 u Brazilu i otkrili novu inačicu ove verzije virusa. Soj "lambda" pronađen 19. srpnja u 29 zemalja

  • Jota

Soj je identificiran u ožujku prošle godine u New Yorku,širio se 35% brže. Neko su se vrijeme uspješno natjecali s alfom, znanstvenici su pretpostavili da bi u kombinaciji s mutacijom E484K u proteinu klas, koji pomaže u bijegu od antitijela, ova opcija bila opasna. TKO mu je dodijelio status prijetnje. No, ta se predviđanja nisu obistinila i sada ga se jednostavno promatra.

Hoće li cjepiva pomoći protiv novih sojeva?

Ne postoji jasan odgovor. Učinkovitost cjepiva može se procijeniti na različite načine: 

  • Pratite kako se mijenja broj novih slučajevainfekcije i hospitalizacije. Na primjer, u Velikoj Britaniji gotovo 88% odrasle populacije primilo je jednu dozu cjepiva, 67% - drugu. U zemlji dominira delta varijanta. Prema službenoj statistici, u proteklom je tjednu stopa incidencije porasla za više od trećine, a broj hospitalizacija za 46,8 posto.
  • Provedite pokus u laboratoriju. Znanstvenici stvaraju pseudovirus sa šiljastim proteinom, dodaju jednu mutaciju za drugom u njegov genom, oponašajući varijantu koja se proučava. Zatim se miješa s krvnim serumom potpuno cijepljenih ljudi i ukapava na staničnu liniju ljudi osjetljivu na koronavirus. Nakon nekoliko dana broje se zaražene stanice.

Čitaj više:

Objasnio kako se svemir odražava u blizini crnih rupa

Masovno trovanje i nove verzije civilizacijske smrti: kako se promijenilo naše znanje o Mayama

UAE testiraju tehnologiju umjetnih oborina u vrućini od 50 stupnjeva