U novom radu autori su stvorili neuronsku mrežu koja određuje kakav će oblik uzeti određeni protein.
Oblik proteina sada se izračunava pomoćuubrzivač čestica koji daje trodimenzionalne fotografije proteinskih molekula ili uz pomoć superračunala koje izračunava njihovu strukturu u skladu sa zakonima kemije i kvantne fizike.
Autori su stvorili evoformer algoritam, kojipokušava odrediti strukturu pojedinih segmenata proteinskih molekula, predstavljajući ih u obliku trodimenzionalnog stabla grafova - matematičke apstrakcije koja se sastoji od skupa objekata povezanih u paru jedan s drugim. Evoformer ih međusobno povezuje, na temelju već poznatih primjera, te postupno mijenja strukturu veza i položaj čvorova, približavajući se optimumu.
Zatim su kombinirali takve algoritme i stvorili neuronsku mrežu AlphaFold2.
Prošle godine smo već predstavili prvu verzijunaš sustav, AlphaFold, koji je mogao predvidjeti strukturu proteina s gotovo atomskom točnošću u sklopu natjecanja CASP13. Sada smo izradili njegovu novu verziju, koja u brzini i točnosti osjetno nadmašuje sve konkurente. Štoviše, njegov je izvorni kod potpuno otvoren.
Demis Hassabis, izvršni direktor Deepminda
Kao rezultat toga, neuronska mreža rekonstruira trodimenzionalni oblik s atomskom preciznošću u otprilike 10 minuta, s pogreškom od 0,096 nanometara za svaki atom unutar proteina.
Čitaj više:
Objasnio kako se svemir odražava u blizini crnih rupa
Masovno trovanje i nove verzije civilizacijske smrti: kako se promijenilo naše znanje o Mayama
Promjene u Zemljinoj orbiti pridonijele su nastanku složenog života na planeti