Znanstvenici probijaju exaflop barijeru kako bi simulirali kvantnu kemiju

Tim predvođen znanstvenicima iz njemačkog Paderborna, profesorom Thomasom D. Kühneom i profesorom Christianom

Plössla je uspjela postati prva grupa na svijetu koja jekoji je probio glavnu barijeru u eksaskali - više od trilijun operacija s pomičnim zarezom u sekundi - za primjene računalne znanosti. Ovim su postignućem postavili novi svjetski rekord.

Znanstvenici su prevladali izazov egzaskaledok simulira šiljasti protein SARS-CoV-2 u stvarnoj znanstvenoj računalnoj aplikaciji. Proboj su napravili uz pomoć superračunala Perlmutter u Nacionalnom znanstvenom računskom centru za istraživanje energije (NERSC) u SAD-u.

Perlmutter je trenutno petinajbrže računalo na svijetu. Osnova je bila nova metoda modeliranja koju su Plössl i Kühne razvili posljednjih godina i integrirali u kvantnokemijski program otvorenog koda CP2K.

U svijetu računarstva visokih performansiBroj aritmetičkih operacija s pomičnim zarezom dvostruke preciznosti (64-bita) obavljenih u sekundi mjerilo je za performanse superračunala.1984. prvi put je dosegnuta brojka od milijardu računskih operacija u sekundi, brojka koju je premašio svaki današnji pametni telefon.

Modeliranje šiljastog proteina SARS-CoV-2 sKoristeći 4400 GPU akceleratora, znanstvenici su premašili prag exaflopsa i dosegli 1,1 exaflops. Za usporedbu, jedan korak simulacije traje 42 sekunde za 83 milijuna atoma, što znači da proces izvodi otprilike 47 × 10 na 18. potenciju operacija s pomičnim zarezom. Bez zahtjeva za memorijom, takav bi izračun trajao oko 13 sati s prvim petaflop sustavom, superračunalom Roadrunner iz 2008., i oko 1,5 godina s prvim teraflop sustavom, ASCI Red, korištenim 1997. godine.

Čitaj više

Majmunske boginje postaju globalni virus: zašto se tako brzo prenose

Nešto se čudno događa u Svemiru: kako objasniti nedosljednosti u Hubble konstanti

Dijagnoza u minuti: kako IT mijenja zdravstvenu zaštitu