Autori su razvili mini-antitijela koristeći softver koji predviđa kako
Ovo je vrlo nevjerojatna stvar! Otvara mnoge mogućnosti.
Stephen Mayo, kemičar na Caltechu
Antitijela se dobro vežu za proteine, npr.s različitim mikrobima. Stoga ih farmaceutske tvrtke koriste kao lijekove za borbu protiv infekcija i raka. Ali antitijela su veliki proteini, pa ih je skupo napraviti, a proces je često nestabilan. Autori studije radili su na prevladavanju tih problema.
Proces kojim se antitijela vežu na metuizgleda poput penjača koji se pokušava popeti na strmu liticu, objašnjava David Baker, računski strukturni biolog sa Sveučilišta Washington (UW). Površina takve stijene je obično glatka, a ima malo potpore za ruke i noge. Antitijela su velika, tako da mogu napraviti više hvatanja u isto vrijeme i čvrsto se držati.
Ali mini-antitijela imaju manje mogućnosti.Istraživači su pokušali prevladati ovaj nedostatak; identificirali su mjesta hvatanja na proteinima i na temelju toga izgradili mini-antitijela. Ali to funkcionira samo za dobro proučene proteine.
Kako bi zaobišli ovaj problem, Baker i kolegeokrenuo se softveru Rosetta, koji su razvili za predviđanje proteinskih struktura na temelju njihove aminokiselinske sekvence. Kako bi stvorio kartu potencijalnih uporišta, tim je zadao program da izračuna koliko će se čvrsto definirane aminokiseline vezati na različite točke na površini ciljnog proteina. Istraživači su koristili Rosettu za stvaranje desetaka tisuća virtualnih mini-antitijela.
Ovaj softver će omogućitiistraživači da razviju dijagnostičke sonde za pomoć u otkrivanju bolesti u ranoj fazi, dodaje Tanya Kortemme, bioinženjerka na Kalifornijskom sveučilištu u San Franciscu.
Možemo dizajnirati proteine zakontaktirajte bilo koju metu. To znači da miniproteini ne samo da mogu blokirati proteine koji uzrokuju bolesti, već i usmjeriti lijekove u kancerogena tkiva ili isporučiti molekule koje emitiraju svjetlost ili radioaktivne dijagnostičke molekule u bilo koju stanicu. To će pomoći pratiti napredak u liječenju.
Longxin Cao, UW postdoc
Čitaj više:
“Peti element” postoji: novi eksperiment potvrdit će da je informacija materijalna
"James Webb" napravio je najjasniju fotografiju zvijezde u povijesti
Kvantno punjenje omogućit će rekordno brzo punjenje električnih vozila