Projekt koristi pristup Perturb-seq, koji vam omogućuje praćenje utjecaja uključivanja ili isključivanja
Pri radu s Perturb-seq tehnologijomistraživači vrše genetske promjene na stanicama koristeći CRISPR-Cas9, a zatim koriste jednostaničnu sekvenciju RNA kako bi prikupili informacije o RNA koja je izražena kao rezultat te genetske promjene. Istraživači primjećuju da RNA kontrolira svaki aspekt ponašanja stanica, pa ova metoda pomaže dešifrirati većinu staničnih učinaka minimalnih genetskih promjena.
U novoj studiji znanstvenici su koristilistanične linije raka ljudske krvi, kao i nekancerozne stanice dobivene iz retine, za izvođenje Perturb-seq na više od 2,5 milijuna stanica. Na temelju dobivenih podataka genetičari su izgradili opsežnu kartu povezujući genotipove s fenotipovima.
Autori vjeruju da će rezultati projekta pomoćibuduća istraživanja. Na primjer, sami tvorci integrirane karte koristili su podatke za proučavanje staničnih učinaka gena s nepoznatim funkcijama, za proučavanje odgovora mitohondrija na stres i za ispitivanje gena koji uzrokuju gubitak ili povećanje kromosoma, fenotip koji je bio teško proučavati u prošlosti.
“Mislim da će ovaj skup podataka omogućiti sve vrste analiza na koje još nismo ni pomislili, ljudima koji dolaze iz različitih područja biologije”, kaže Tom Norman, koautor studije.
Čitaj više
Japanci su bacili divovsku turbinu u ocean kako bi dobili beskrajnu energiju iz struje.
Postoji način za poboljšanje fuzije: to je izvor beskonačne energije
Astronomi iz Japana pronašli su nepoznatu strukturu u galaksiji