SARS-CoV-2 je evoluirao kako bi stekao mutacije u proteinu šiljaka, dijelu virusa koji djeluje kaosa svojim
Zasluge: Hin Hark Gan i Christine Gansalus, Odjel za biologiju NYU.
Znanstvenici nagađaju da su ove mutacije u spike proteinu ključni razlog za brzo širenje virusa u nekim dijelovima svijeta.
Posljednjih mjeseci sve više i višezaraznih sojeva koronavirusa, što dovodi do novih valova epidemije u zemljama poput Indije i Brazila. Pogoršanje situacije zahtijeva metode za brzo predviđanje novih zaraznih virusnih sojeva. No, praćenje novih mogućnosti nije lak zadatak; sekvenciranje genoma pokazuje da samo šiljasti protein SARS-CoV-2, na primjer, ima oko 5000 mogućih varijanti.
Provjera tako širokog raspona mogućnostipredstavlja veliki izazov tradicionalnim eksperimentalnim metodama, napominju znanstvenici. Prednost računalnih simulacija je u tome što se stotine mutacija može lako procijeniti u nekoliko dana.
Znanstvenici su se okrenuli računalnoj metodi koja modelira kako protein šiljaka SARS-CoV-2 prepoznajeACE2 receptor - protein na površini mnogih tipova stanica - za ulazak u stanice domaćina. Procijenili su 1003 kombinacije mutacija proteina šiljaka koronavirusa, uključujući one koje su dovele do porasta infekcija u Brazilu, Južnoj Africi, Velikoj Britaniji i Indiji.
Sustavna procjena opcija pokazala je toŠiljaste mutacije koje se čvrsto vežu za ACE2 receptor javljaju se u dvije skupine ili "žarišne točke" mutacija na sučelju vezanja. Nalaze se u strukturno fleksibilnim regijama. To znači da su mutacije koje povećavaju vezanje učinkovito reprogramirale konformaciju kralježnice kako bi povećale njezinu sposobnost prepoznavanja ACE2 receptora.
Studija je objavljena u Časopis za molekularnu biologiju.
Pročitajte i
Skyborg autonomni bespilotni letjelica USAF-a izvodi prvi let
U Australiji je pronađen ogromni moljac. Raspon krila joj je 25 cm
Znanstvenici su betonske kuće pretvorili u baterije