Az AI segít felismerni az ősi vírusok RNS-maradványait az emberi genomban

Korábbi vizsgálatok kimutatták, hogy amikor a vírus bejut az emberi (és más állati) szervezetbe, az

 rész hozzáadásával megváltoztathatja a gazdaszervezet DNS-étsaját RNS-e. Az is ismert, hogy az ősi vírusok, amelyek sok évvel ezelőtt megfertőzték a lakosságot, néha RNS-maradványokat hagytak az emberi genomban. Megtalálásuk azonban nehéz feladatnak bizonyult az egyes „gyanús” vírusokhoz szükséges rengeteg összehasonlítás miatt. Az új munkában a kutatók gépi tanulási algoritmust használtak a probléma megoldására.

Az algoritmus betanításához a tudósok aismert nem retrovírusos endogén RNS víruselemek. A modern vírusos RNS algoritmusának betanításával a rendszer megérezhette, hogy néz ki egészében. A kutatók úgy vélik, hogy ilyen hasonlóságok valószínűleg léteztek az ősi RNS-ben is. Edzés után a tudósok módosították a rendszert, hogy megakadályozzák a lehető legtöbb hamis pozitív eredményt. Ezután lefuttatták az emberi genomot, és körülbelül 100 lehetőséget találtak további megfontolásra. Megvizsgálásuk után a kutatók megállapították, hogy közülük sokan már ismertek, és néhányuk a küszöb alatt van, amelyet passz / sikertelenségként határoztak meg. Egyetlen ismeretlen vírus maradványa van hátra.

Később a tudósok megvizsgálták, hogy találtak-e ugyaneztreziduális vírus RNS más fajok, például majmok és csimpánzok genomjában. Ez a felfedezés arra utal, hogy a fertőzés és a további DNS-módosítás legalább 43 millió évvel ezelőtt történt.

A kutatók megjegyezték, hogy az ősi vírusokról és azok emberi genomra gyakorolt ​​hatásáról szóló további információk betekintést nyújtanak a modern vírusok viselkedésének még mindig ismeretlen árnyalataiba.

Olvass tovább

Abortusz és tudomány: mi lesz a gyerekekkel, akik szülni fognak

A radarok megtalálták az utolsó alaszkai Tlingit erődöt. Több mint 100 éve keresik

A COVID-19-ből felépültek egyharmada visszatér a kórházba. Minden nyolcadik - meghal