Eddig 3,9 millió ember halt meg világszerte az új típusú koronavírus miatt. A járvány kezdetén
Egy seattle-i kutató most törölt fájlokat fedezett fel a Google Cloud szolgáltatásból, amelyek 13 parciális genetikai szekvenciát tárnak fel a COVID-19 legkorábbi eseteiből Wuhanban.
A sorozatok nem döntik meg az egyensúlyta SARS-CoV-2 eredetével kapcsolatos számos elméletből vagy abból. Nem támasztják alá például azt az elméletet, hogy a vírus egy vuhani fokozottan biztonságos laboratóriumból szivárgott ki. A bizonyítékok azonban azt sugallják, hogy az új koronavírus már azelőtt keringett, hogy az első nagyobb járványt felfedezték volna a kínai tartomány tengeri piacán.
Pontosan meghatározni, hogyan és hol történtvírus, a tudósoknak meg kell találniuk az úgynevezett prekurzor vírust, amelyből az összes többi törzs származik. Eddig a legkorábbi szekvenciákat többnyire a wuhani Huanan Seafood Market eseteiből vették át. Eredetileg feltételezték, hogy a SARS-CoV-2 először 2019 december végén jelent meg. Azonban az év december elejétől novemberig tartó eseteknek nem volt piaci kapcsolatuk. Ez azt jelzi, hogy a vírus más helyről származik.
A piacon talált esetek közül három vana piacon kívül hetekkel később kimutatott vírusmintákban hiányzó mutációk. A mutációk nélküli vírusok jobban illeszkednek a patkós denevérekben található koronavírusokhoz. A tudósok bíznak abban, hogy az új koronavírus valahogy denevérektől származik, ezért logikus azt feltételezni, hogy az ősembernek sem voltak ilyen mutációi.
És most Jesse Bloom az Orvosi IntézettőlHoward Hughes Seattle-ben felfedezte, hogy a törölt szekvenciaadatok (valószínűleg néhány a vírus legkorábbi mintáiból) szintén hiányozták ezeket a mutációkat.
Körülbelül egy évvel ezelőtt 241 genetikaia koronavírusos betegek szekvenciája eltűnt a Sequence Read Archive-ból, az Országos Egészségügyi Intézetek (NIH) által fenntartott online adatbázisból.
Bloom észrevette a hiányzó szekvenciákat,amikor egy táblázatba botlottam egy tanulmányban, amelyet 2020 májusában publikáltak a PeerJ-ben. Részt vettek a Wuhani Egyetem PRJNA612766 projektjében, és állítólag feltöltötték őket az archívumba. A tudós az archív adatbázisban szekvenciákat keresett, és megkapta az "Elemek nem találhatók" üzenetet.
Vizsgálata során kiderült, hogy a törölta szekvenciákat a Wuhani Egyetemi Kórház gyűjti össze. Ugyanakkor a tanulmány ezeken a szekvenciákon alapuló publikációja azt sugallja, hogy azokat a járvány kezdetén COVID-19 gyanújú járóbetegek orrvessző mintáiból vették.
Bloom nem tudott magyarázatot találni arra, hogy miért távolították el a szekvenciákat, és miért nem válaszoltak a tanulmány szerzőinek küldött e-mailjeire.
A tudós megjegyzi, hogy „nincs meggyőző tudományosaz adatok törlésének okai." A lényeg az, hogy a sorozatok teljes mértékben megfeleljenek a munkában leírt mintáknak. A dokumentumban nincsenek javítások. Ezenkívül a tanulmány hangsúlyozza, hogy a mintákat önkéntesen vették egyénektől, és a szekvenálás nem mutat bizonyítékot a plazmid szennyeződésre vagy a minták szennyeződésére. „Valószínűnek tűnik, hogy a szekvenciákat azért távolították el, hogy eltitkolják létezésüket” – összegzi Bloom.
Eredményeivel egy cikk jelent meg a biorxiv preprint honlapján.
Olvass tovább
A történelem legnagyobb üstökösét a Naprendszer látja: szinte bolygó
Az új módszer a szénből azonnal grafént vagy gyémántot eredményez
Talált egy olcsó módszert a megavárosok központjainak a túlmelegedéstől való megmentésére