A szerzők mini-antitesteket fejlesztettek ki olyan szoftver segítségével, amely megjósolja, hogyan
Ez egy nagyon elképesztő dolog! Sok lehetőséget nyit meg.
Steven Mayo, a California Institute of Technology vegyésze
Az antitestek jól kötődnek a fehérjékhez, például a különböző mikrobákhoz.fertőzések és rák elleni gyógyszerekként.De az antitestek nagy fehérjék, ezért drága az előállításuk, és gyakran ezA tanulmány szerzői igyekeztek megkerülni ezeket a problémákat.
Az a folyamat, amelynek során az antitestek egy célponthoz kötődnekÚgy néz ki, mint egy sziklamászó, aki egy puszta sziklán próbál felmászni – magyarázza David Baker, a Washingtoni Egyetem (UW) számítógépes szerkezetbiológusa. Az ilyen szikla felülete általában sima, és kevés a karok és lábak megtámasztása. Az antitestek nagyok, így egyszerre több fogást is képesek megfogni, és szilárdan tartani tudnak.
De a mini-antitesteknek kevesebb lehetőségük van.A hiba, hogy azonosították a fehérjék befogási helyeit, és ez alapján mini-antitesteket építettek.De ez csak jól tanulmányozott fehérjék esetében működik.
A probléma megkerülése érdekében Baker és munkatársaia Rosetta szoftverhez fordultak, amelyet azért fejlesztettek ki, hogy aminosavszekvenciájuk alapján előre jelezzék a fehérjeszerkezeteket. A potenciális támpontok térképének elkészítése érdekében a csapat azzal a feladattal bízta meg a programot, hogy kiszámítsa, milyen szorosan meghatározott aminosavak kötődnek a célfehérje felszínének különböző pontjaihoz. A kutatók a Rosetta segítségével több tízezer virtuális mini-antitestet hoztak létre.
Ez a szoftver lehetővé tesziTanya Kortemme, a San Francisco-i Kaliforniai Egyetem biomérnöke a kutatók olyan diagnosztikai szondák kifejlesztésére, amelyek segítik a betegségek korai stádiumában történő felismerését.
Megtervezhetjük a fehérjéketlépjen kapcsolatba bármely céllal. Ez azt jelenti, hogy a miniproteinek nem csak a betegséget okozó fehérjéket képesek blokkolni, hanem gyógyszereket is a rákos szövetekbe irányíthatnak, vagy fénykibocsátó vagy radioaktív diagnosztikai molekulákat juttathatnak bármely sejtbe. Ez segít nyomon követni a kezelés előrehaladását.
Longxing Cao, UW Postdoc
Olvass tovább:
Az „ötödik elem” létezik: egy új kísérlet megerősíti, hogy az információ lényeges
"James Webb" a történelem legtisztább fotóját készítette egy sztárról
A kvantumtöltés lehetővé teszi az elektromos járművek rekordnagyságú gyorstöltését