A tudósok több mint 1000 mutáció-kombinációt vizsgáltak a koronavírus tövisfehérjéiben

A SARS-CoV-2 úgy fejlődött ki, hogy mutációkat szerezzen a tüskeproteinben, a vírus azon részén, amely kilóg a vírusból.

felületekre és a sejtekhez tapad azértfertőzés. A koronavírus ezen részének mutációi növelik a képességét, hogy kötődjön az emberi sejtekhez vagy elkerülje az antitesteket. A New York-i Egyetem Genomikai és Rendszerbiológiai Központja és az Abu-Dzabi New York-i Egyetem új tanulmánya számítógépes modellezést használ a tüskefehérje-mutációk biológiai jelentőségének felmérésére. A cél a vírus azon változatainak azonosítása, amelyek erősebben kötődnek az ACE2 receptorhoz, vagy ellenállóbbak az antitestekkel szemben.

Hitel: Hin Hark Gan és Christine Gansalus, NYU Biológiai Tanszék.

A tudósok feltételezik, hogy ezek a tüskefehérje mutációi a legfontosabb oka a vírus gyors elterjedésének a világ egyes részein.

Az elmúlt hónapokban új és még sok mása koronavírus fertőző törzsei, amelyek a járvány új hullámaihoz vezetnek olyan országokban, mint India és Brazília. A romló helyzet megköveteli az új fertőző vírustörzsek gyors előrejelzésének módszereit. De az új lehetőségek nyomon követése nem könnyű feladat; a genom szekvenálása azt mutatja, hogy például a SARS-CoV-2 tüskefehérjében például körülbelül 5000 lehetséges variáns van.

Szűrés ilyen sokféle lehetőségértóriási kihívást jelent a hagyományos kísérleti módszerekkel szemben - jegyzik meg a tudósok. A számítógépes szimulációk előnye, hogy száz mutáció könnyen becsülhető néhány nap alatt.

A tudósok a számítási módszerhez fordultakamely modellezi, hogy a SARS-CoV-2 tüskeprotein hogyan ismeri fel az ACE2 receptort – számos sejttípus felszínén található fehérjét –, hogy bejusson a gazdasejtekbe. 1003 mutáció-kombinációt vizsgáltak meg a koronavírus tüskeproteinjében, beleértve azokat is, amelyek a fertőzések megugrása Brazíliában, Dél-Afrikában, az Egyesült Királyságban és Indiában.

A lehetőségek szisztematikus értékelése azt mutattaAz ACE2-receptorhoz szorosan kötődő tüskemutációk a kötődési felületen lévő mutációk két csoportjában vagy "forró pontjában" fordulnak elő. Szerkezetileg rugalmas régiókban találhatók. Ez azt jelenti, hogy a kötődést növelő mutációk hatékonyan átprogramozták a gerinc konformációját, hogy fokozzák annak képességét az ACE2 receptorok felismerésére.

A tanulmány a Journal of Molecular Biology.

Olvassa el

Az USAF Skyborg autonóm drónja megteszi első járatát

Hatalmas lepkét találtak Ausztráliában. Szárnyfesztávolsága 25 cm

A tudósok a betonházakat elemekké változtatták