A DeepMind adatbázis szinte minden, a tudomány által ismert fehérjét tartalmazott. Körülbelül 200 millió

Tavaly a DeepMind kiadott egy nyílt forráskódú adatbázist, amely több százezer 3D struktúrát tartalmaz

fehérjék, beleértve mind a 20 000 ismert fehérjétemberi test. Most ezt az AlphaFold fehérjeszerkezeti adatbázist 200 millió szerkezetre bővítették, beleértve a tudomány által ismert szinte összes fehérjét.

A fehérjék aminosavláncokból állnak, amelyekbonyolult háromdimenziós formákká hajtogatni, amelyek meghatározzák a funkciójukat. A fehérjék szerkezetének feltérképezése fontos annak megértéséhez, hogy mit csinálnak, hogyan működnek, és hogy a dolgok miként ronthatnak el. Azonban még mindig nehéz kiszámítani a fehérje pontos szerkezetét az alkotó aminosavak alapján. Ez általában hatalmas számítási teljesítményt és munkaórákat igényel.

Ez így volt ábécéigennek a problémának a megoldására irányította hatalmas mesterséges intelligenciáját, a DeepMind-et. A kezdetben 100 000 ismert fehérjeszerkezetre kiképzett rendszer képes volt megjósolni sok millió más fehérje szerkezetét, amelyek meghatározása percekig vagy másodpercekig tart, nem pedig hónapok vagy évek.

Nemrég a DeepMind kiadott egy új nagyszabásúaz adatbázis frissítése, amely jelenleg mintegy 214 millió szerkezetet tartalmaz egymillió fajból. Ez szinte minden, a tudomány által ismert fehérjére vonatkozik, ami óriási segítséget jelent a betegségek kezelésével, vakcinákkal, antibiotikum-rezisztenciával, sőt a műanyagszennyezéssel kapcsolatos kutatásokhoz.

A több mint 25 terabájtnyi adatot tartalmazó teljes fehérjeszerkezet-adatbázis letölthető a Google Cloud Public Datasets szolgáltatásból.