Il nuovo algoritmo accelererà la creazione di cellule artificiali da diversi anni a mesi

Il nuovo sviluppo consentirà agli scienziati di non spendere anni per una comprensione dettagliata di ogni parte della cellula e delle sue specifiche

Invece, con un set limitato di dati di addestramento, i nuovi algoritmi prediranno come i cambiamenti nel DNA influenzerannosul comportamento della cellula e sulla sua biochimica, quindi formulare raccomandazioni per il prossimo ciclo di ingegneria, insieme a probabili previsioni per raggiungere l'obiettivo desiderato dagli ingegneri.

"Le opportunità sono rivoluzionarie", ha detto HectorGarcia Martin, ricercatore della Divisione di sistemi e ingegneria biologica (BSE) dei Berkeley Laboratories, che ha condotto lo studio. “La bioingegneria è attualmente un processo molto lento. Ci sono voluti 150 anni-uomo per sviluppare il farmaco antimalarico, l'artemisinina. Se è possibile creare nuove cellule secondo le specifiche in un paio di settimane o mesi invece che in pochi anni, ciò rivoluzionerà le possibilità della bioingegneria ".

Lavorare con uno specialista di analisiSulla base dei dati sulla BSE di Tijana Radivojevic e di un team internazionale di ricercatori, il team ha sviluppato e dimostrato un algoritmo in attesa di brevetto, l'Automatic Recommendation Tool (ART). L’apprendimento automatico consente ai computer di fare previsioni dopo essere stati “addestrati” sulla base di una quantità significativa di dati disponibili.

L'algoritmo è adattato alle caratteristiche dell'areabiologia sintetica con i suoi piccoli set di dati di addestramento, la necessità di quantificare l'incertezza e i cicli ricorsivi. Le capacità di questo strumento sono state dimostrate con simulazioni e dati storici di precedenti progetti di ingegneria metabolica, come il miglioramento della produzione di biocarburanti rinnovabili.

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