L'intelligenza artificiale aiuta a riconoscere i residui di RNA di virus antichi nel genoma umano

Studi precedenti hanno dimostrato che quando il virus entra nel corpo umano (e in altri animali),

 può cambiare il DNA dell'ospite aggiungendo parteil proprio RNA. È anche noto che gli antichi virus che infettarono la popolazione molti anni fa a volte lasciarono resti del loro RNA nel genoma umano. Tuttavia, trovarli si è rivelato un compito difficile a causa dell’enorme numero di confronti richiesti per ciascun virus “sospetto”. Nel nuovo lavoro, i ricercatori hanno utilizzato un algoritmo di apprendimento automatico per risolvere il problema.

Per addestrare l'algoritmo, gli scienziati hanno utilizzato l'RNA dielementi virali RNA endogeni noti non retrovirali. Addestrando l'algoritmo del moderno RNA virale, il sistema potrebbe avere un'idea di come appare nel suo insieme. I ricercatori ritengono che tali somiglianze esistessero probabilmente anche nell'antico RNA. Dopo la formazione, gli scienziati hanno ottimizzato il sistema per prevenire il maggior numero possibile di falsi positivi. Lo hanno poi eseguito sul genoma umano e hanno trovato circa 100 opzioni per ulteriori considerazioni. Dopo averli esaminati, i ricercatori hanno scoperto che molti di essi erano già noti e alcuni erano al di sotto della soglia impostata come opzione di superamento / fallimento. È rimasto solo un possibile residuo di un virus sconosciuto.

Successivamente, gli scienziati hanno verificato se hanno trovato lo stessoRNA virale residuo nei genomi di altre specie, come scimmie e scimpanzé. Questa scoperta suggerisce che l'infezione e l'ulteriore alterazione del DNA si siano verificate almeno 43 milioni di anni fa.

I ricercatori hanno notato che maggiori informazioni sui virus antichi e sul loro impatto sul genoma umano forniranno informazioni sulle sfumature del comportamento dei virus moderni che sono ancora sconosciute.

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