Gli scienziati hanno scoperto le impronte digitali di misteriosi virus che si nascondevano in un antico gruppo di microbi.
Questa settimana sulla rivista Nature Microbiologytre articoli dedicati ai virus degli archaea del gruppo di Asgard sono stati pubblicati contemporaneamente. Gli scienziati hanno esaminato i genomi dei virus da dati genomici e metagenomici e hanno studiato la loro relazione con i gruppi di virus più famosi. I dati ottenuti hanno aiutato gli scienziati a indovinare quali fossero esattamente le funzioni dei virus che hanno infettato gli Asgard archaea.
In particolare, questo è il primo studiovirus arcaici di Asgard; prima non si sapeva nulla. In futuro, questa linea di ricerca potrebbe mostrare se e come i virus siano stati coinvolti nell'emergere di cellule eucariotiche sulla Terra.
In generale, gli archaea del gruppo Asgard hanno molti geniche codificano proteine eucariotiche. Gli scienziati li considerano anche i parenti più stretti degli eucarioti. Tuttavia, fino ad ora, i ricercatori non sapevano se le somiglianze tra i membri del gruppo Asgard e gli eucarioti si estendessero ai virus che li infettano.
Il primo gruppo di scienziati ha analizzatosequenze metagenomiche. Sono stati ottenuti da depositi idrotermali di acque profonde. I biologi hanno raccolto sei genomi di virus che infettano gli archaea del gruppo Asgard. Si è scoperto che appartengono a quattro virus, si chiamavano Fenrir (Fenrir), Sköll (Skoll), Nidhogg (Nidhogg) e Ratatoskr (Ratatoskr). Sono tutte creature della mitologia scandinava.
Sulla base di dati genomici, biologihanno suggerito che sono in grado di replicare, riparare, modificare epigenetica e regolazione trascrizionale del genoma semi-autonomo. Combinano anche le caratteristiche dei virus batterici e arcaici.
Un altro gruppo di scienziati ha ottenuto il genoma completo di un archaeadal gruppo Asgard e riassemblato il genoma del ceppo LCB_4, che era considerato un gruppo basale del phylum Odinarchaeota. I biologi hanno scoperto le sequenze di due virus, sono stati chiamati Huginn e Muninn (Hugin e Munin sono una coppia di corvi nella mitologia scandinava che volano intorno al mondo di Midgard e riferiscono al dio Odino ciò che sta accadendo). Virus ad essi correlati sono stati trovati nei genomi di altri procarioti, compresi gli archaea del gruppo Asgard.
Il terzo lavoro è dedicato all'assemblaggio metagenomico 20nuovi virus archaeal del gruppo Asgard da campioni di sedimenti. Combinando l’analisi filogenetica con la ricerca dei loci CRISPR nei dati metagenomici, i ricercatori hanno diviso i virus trovati in tre gruppi a livello familiare.
Alla fine, i ricercatori sono riusciti a capire le funzioni solo di alcuni geni del virus. Le funzioni della stragrande maggioranza dei geni sono ancora sconosciute.
Asgard o Asgardarchaeota - presuntoun superphylum costituito da un gruppo di archaea che comprende Lokiarchaeota, Thorarchaeota, Odinarchaeota e Heimdallarchaeota. Sembra che gli eucarioti abbiano avuto origine all'interno di Asgard, nel ramo contenente gli Heimdallarchaeota. Ciò significa che gli archaea del gruppo Asgard, suggeriscono molti biologi, sono i più vicini agli antenati di tutti gli organismi dotati di nuclei cellulari. Potrebbero aver contribuito all’emergere di una vita complessa
I risultati della ricerca possono essere trovati qui, qui e qui.
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