Ad oggi, il nuovo tipo di coronavirus ha causato 3,9 milioni di morti in tutto il mondo. All'inizio della pandemia
Ora, un ricercatore con sede a Seattle ha scoperto file cancellati da Google Cloud che rivelano 13 sequenze genetiche parziali di alcuni dei primi casi di COVID-19 a Wuhan.
Le sequenze non fanno pendere l'ago della bilanciada o da molte teorie sull’origine della SARS-CoV-2. Ad esempio, non supportano la teoria secondo cui il virus sarebbe fuoriuscito da un laboratorio di massima sicurezza a Wuhan. Tuttavia, le prove suggeriscono che il nuovo coronavirus circolava anche prima che il primo grande focolaio fosse scoperto in un mercato ittico nella provincia cinese.
Per individuare esattamente come e dove è successoun virus, gli scienziati devono trovare il cosiddetto virus precursore da cui hanno avuto origine tutti gli altri ceppi. Finora, le prime sequenze sono state per lo più prese da casi al mercato del pesce di Huanan a Wuhan. Inizialmente si ipotizzava che SARS-CoV-2 fosse apparso per la prima volta alla fine di dicembre 2019. Tuttavia, i casi dall'inizio di dicembre a novembre di quell'anno non avevano alcun legame con il mercato. Ciò indica che il virus ha avuto origine da una posizione diversa.
I casi trovati sul mercato includono tremutazioni che sono assenti nei campioni di virus rilevati settimane dopo al di fuori del mercato. I virus senza mutazioni corrispondevano più da vicino ai coronavirus trovati nei pipistrelli ferro di cavallo. Gli scienziati sono fiduciosi che il nuovo coronavirus abbia avuto origine in qualche modo dai pipistrelli, quindi è logico supporre che anche il progenitore non avesse queste mutazioni.
E ora Jesse Bloom del Medical InstituteHoward Hughes a Seattle ha scoperto che anche i dati della sequenza cancellata (probabilmente alcuni dei primi campioni del virus) erano privi di queste mutazioni.
Circa un anno fa, 241 geneticala sequenza dei pazienti con coronavirus è scomparsa dal Sequence Read Archive online, che è gestito dal National Institutes of Health (NIH).
Bloom notò le sequenze mancanti,quando mi sono imbattuto in un foglio di calcolo in uno studio pubblicato nel maggio 2020 su PeerJ. Facevano parte del progetto dell'Università di Wuhan PRJNA612766 e sarebbero stati caricati nell'archivio. Lo scienziato ha cercato le sequenze nel database dell'archivio e ha ricevuto il messaggio "Elementi non trovati".
La sua indagine ha rivelato che il cancellatole sequenze sono raccolte dal Wuhan University Hospital. Allo stesso tempo, la prestampa dello studio, pubblicata sulla base di queste sequenze, suggerisce che siano stati prelevati da campioni di tamponi nasali da pazienti ambulatoriali con sospetto COVID-19 all'inizio dell'epidemia.
Bloom non è stato in grado di trovare alcuna spiegazione sul motivo per cui le sequenze sono state rimosse e le sue e-mail agli autori dello studio non hanno ricevuto risposta.
Lo scienziato osserva che “non esiste alcuna prova scientifica convincentemotivi per eliminare i dati." Il punto è che le sequenze corrispondono pienamente ai campioni descritti nel lavoro. Non ci sono correzioni nel documento. Inoltre, lo studio sottolinea che i campioni sono stati ottenuti volontariamente da individui e il sequenziamento non mostra prove di contaminazione da plasmidi o di contaminazione dei campioni. "Sembra probabile che le sequenze siano state rimosse per nasconderne l'esistenza", conclude Bloom.
Un articolo con le sue scoperte è stato pubblicato sul sito web di prestampa biorxiv.
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