Il coronavirus muta: cinque sottotipi su sei sono ora più contagiosi

Il modello, sviluppato dal ricercatore capo Guowei Wei, professore presso il Dipartimento di Matematica, Biochimica e

biologia molecolare, analizzatagenotipizzazione del SARS-CoV-2 da oltre 20.000 campioni di genoma virale. I ricercatori hanno anche esaminato le mutazioni nella proteina Spike – la proteina principalmente responsabile della diffusione dell’infezione – e hanno scoperto che cinque dei sei sottotipi conosciuti del virus sono ora più contagiosi.

Come con qualsiasi virus, molte mutazioni inin definitiva benigno, con rischio minimo o nullo per i pazienti infetti. Alcune mutazioni riducono persino l'infettività. Ma alcuni di loro rendono il virus più contagioso.

Wei e il suo team hanno trascorso diversi mesi studiando e analizzando i modelli e i siti delle mutazioni, monitorando i cambiamenti dal campione ufficiale del genoma virale ottenuto a gennaio.

La conoscenza dell'infettività di SARS-CoV-2 èvitale per prevenire COVID-19 e ripristinare l'economia globale. La domanda chiave è quali sono le implicazioni di queste mutazioni per la trasmissione, la diagnosi, la prevenzione e il trattamento di COVID-19.

Guowei Wei, Professore del Dipartimento di Matematica, Biochimica e Biologia Molecolare

Un'infezione virale si verifica quando un piccola proteina interagisce con un recettore della cellula ospite umana, l'enzima di conversione dell'angiotensina 2, abbreviato ACE2. Per quanto riguarda ACE2, gli scienziati sono preoccupati per un concetto noto come affinità di legame, o la forza dell'interazione di legame tra la proteina spike e il recettore ospite nelle prime fasi dell'infezione.

L'infettività del virus aumenta sel'affinità di legame aumenta. Sono state ora trovate più di 50 mutazioni, così come un'interfaccia di legame sul dominio di legame del recettore delle proteine ​​a spillo - RBD in breve, che ha 194 possibili siti di mutazione, spiega il ricercatore.

Il modello di apprendimento automatico di Wei, avanzatoLa rete neurale ha analizzato oltre 8.000 record di interazioni proteiche per determinare l'effetto delle mutazioni note correnti sull'affinità di legame della proteina spike SARS-CoV-2. Il risultato, che ha suggerito una maggiore affinità di legame in cinque dei sei sottotipi noti, ha indicato che l'infettività potrebbe essere aumentata dalle mutazioni.

Preoccupati per la possibilità di ulteriori mutazioni, Wei e il suo team si sono rivolti al loro modello del futuro.

È estremamente importante sapere se il futuroi sottotipi di SARS-CoV-2 rappresentano una minaccia imminente per la salute pubblica. A tal fine, abbiamo eseguito uno screening sistematico di tutte le possibili 3.686 mutazioni future in 194 siti di possibili mutazioni lungo il RBD.

Guowei Wei, Professore del Dipartimento di Matematica, Biochimica e Biologia Molecolare

Il modello di Wei prevede che più residui nel motivo di legame del recettore - un componente della regione RBD - hanno un'alta probabilità di mutare in ceppi COVID-19 più infettivi.

Lo avverte, sebbene basato sulle previsionisull'intelligenza artificiale sono coerenti con i dati sperimentali disponibili, sono necessarie ulteriori ricerche per comprendere appieno l'effetto delle mutazioni sull'infettività di COVID-19.

Come parte della loro ricerca, Wei e il suo teamSi prevede inoltre che il nuovo coronavirus, che si sta diffondendo in tutto il mondo, sia leggermente più contagioso del virus SARS originale scoperto nel 2003.

Wei ha affermato che i risultati sono gli stessi dii risultati di un altro esperimento recentemente pubblicato dagli scienziati dello Scripps Research Institute in Florida. Questo studio ha esaminato le mutazioni dei picchi proteici in vitro e ha scoperto che il virus è mutato in modo tale da aumentare la sua contagiosità.

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