Ricerca pubblicata inNature Communications, ha dimostrato che la piattaforma di prossima generazione
“Identificazione rapida e accurata del positivoIl campionamento è fondamentale nella lotta contro questa pandemia, afferma il dottor Jeff Vrana, ricercatore senior presso LTRI e professore presso il Dipartimento di genetica molecolare presso l'Università di Toronto. - Sono attualmente in circolazione nuove e potenzialmente pericolose varianti del coronavirus. La nuova piattaforma scalabile e automatizzata è in grado di analizzare migliaia di campioni di pazienti COVID-19 in una singola corsa ".
Il progetto ha coinvolto un team di stagisti chisi è trasferito da altre aree di ricerca per aiutare a sviluppare e convalidare la piattaforma. Ciò ha permesso al team di passare dal concetto all'articolo pubblicato in meno di 12 mesi.
Javier Hernandez in questa fotografia d'archivio non datata al laboratorio Wrana presso l'Istituto di ricerca Lunenfeld-Tanenbaum a Toronto, in Canada. Credito: Sinai Health.
Alla fine del 2020, la squadra ha deciso di nuovoutilizzare una piattaforma robotica per esaminare migliaia di campioni positivi per le varianti sequenziando rapidamente le regioni del genoma virale utilizzando le impronte digitali per cercare le mutazioni chiave.
Il nuovo sistema SPAR-Seq è all'avanguardiatecnologia e la capacità di sequenziare i campioni in tempo reale ha un enorme potenziale per influenzare la comprensione degli scienziati dell'epidemiologia e la diffusione di nuove mutazioni del coronavirus.
La piattaforma è anche economica. Lo studio rileva che quando si eseguono migliaia di campioni contemporaneamente, il costo di un singolo test è solo di circa $ 8.
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Sinai Health System è un sistema ospedaliero,che serve Toronto, Ontario, Canada. Ha due ospedali, Mount Sinai Hospital e Bridgepoint Active Healthcare, entrambi di proprietà della University of Toronto School of Medicine.