Gli autori hanno sviluppato mini-anticorpi utilizzando un software che prevede come
Questa è roba davvero incredibile! Apre molte possibilità.
Stephen Mayo, chimico del Caltech
Gli anticorpi si legano bene alle proteine, ad es.con microbi diversi. Pertanto, le aziende farmaceutiche li utilizzano come farmaci per combattere infezioni e cancro. Ma gli anticorpi sono proteine di grandi dimensioni, quindi sono costosi da produrre e il processo è spesso instabile. Gli autori dello studio hanno lavorato per superare questi problemi.
Il processo mediante il quale gli anticorpi si legano a un bersagliosembra uno scalatore che cerca di scalare una scogliera a strapiombo, spiega David Baker, biologo strutturale computazionale presso l'Università di Washington (UW). La superficie di una tale roccia è solitamente liscia e c'è poco supporto per braccia e gambe. Gli anticorpi sono grandi, quindi possono fare molte prese contemporaneamente e tenersi saldamente.
Ma i mini-anticorpi hanno meno possibilità.I ricercatori hanno cercato di superare questa lacuna, identificando i siti di cattura delle proteine e costruendo su questa base dei minianticorpi. Ma questo funziona solo per proteine ben studiate.
Per aggirare questo problema, Baker e colleghisi sono rivolti al software Rosetta, che hanno sviluppato per prevedere le strutture proteiche in base alla loro sequenza di amminoacidi. Per creare una mappa dei potenziali punti d'appoggio, il team ha incaricato il programma di calcolare il modo in cui gli aminoacidi ben definiti si legherebbero a vari punti sulla superficie della proteina bersaglio. I ricercatori hanno utilizzato Rosetta per creare decine di migliaia di mini-anticorpi virtuali.
Questo software consentiràricercatori per sviluppare sonde diagnostiche per aiutare a rilevare le malattie in una fase iniziale, aggiunge Tanya Kortemme, bioingegnere presso l'Università della California, San Francisco.
Possiamo progettare proteine percontattare qualsiasi bersaglio. Ciò significa che le miniproteine non solo possono bloccare le proteine che causano malattie, ma anche indirizzare i farmaci ai tessuti cancerosi o fornire molecole diagnostiche che emettono luce o radioattive a qualsiasi cellula. Ciò contribuirà a tenere traccia dei progressi nel trattamento.
Longxin Cao, postdoc dell'UW
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