Frontera ha contribuito a creare i primi modelli realistici del capside dell'HIV-1, completi di proteine, acqua, elementi genetici
Modello capside
"Siamo stati in grado di trovare una vulnerabilità nel capside del virus HIV-1 con le simulazioni e le analisi su larga scala che abbiamo fatto", ha affermato Gregory Wath, professore emerito all'Università di Chicago.
I ricercatori hanno utilizzato i dati sperimentali e sviluppato una simulazione a atomi completi della dinamica molecolare del capside dell'HIV-1. La simulazione consisteva di 100 milioni di atomi.
L'immagine risultante mostra scanalature, appaiono nel processo di sollecitazione e deformazione. Possono essere usati per capire dove si contrae o si espande il reticolo proteico.
Posizioni di scanalature nella simulazione
Tale ricerca aiuta a creare farmaci che funzionano secondo la strategia ottimale e colpiscono i punti deboli del virus.
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