Il supercomputer mostra perché le nuove varianti di coronavirus sono più contagiose e mortali

Tutti i virus mutano mentre si copiano per diffondersi. Il SARS-CoV-2, il virus che causa il COVID-19, non lo è

divenne un'eccezione. Attualmente esistono più di 4.000 varianti del COVID-19, che ha già ucciso più di 2,7 milioni di persone in tutto il mondo durante la pandemia.

Variante britannica, nota anche come B.1.1.7, scoperto per la prima volta nel settembre 2020 e ora causa del 98% di tutti i casi di COVID-19 nel Regno Unito. Si è anche diffuso in circa 100 altri paesi, tra cui Francia, Danimarca e Stati Uniti.

Lo dice l'Organizzazione mondiale della sanitàche B.1.1.7 è una delle numerose opzioni preoccupanti, insieme ad altre, emergenti in Sud Africa e Brasile. "Le varianti del virus nel Regno Unito, Sud Africa e Brasile sono più contagiose e più facili da eliminare dall'immunità rispetto al virus originale", spiega Victor Padilla-Sanchez, ricercatore presso l'Università Cattolica d'America. "Dobbiamo capire perché sono più contagiosi e in molti casi più mortali".

Tutte e tre le varianti hanno subito cambiamenti nella loro proteina spike, la parte del virus che si lega alle cellule umane. Di conseguenza, infettano meglio le cellule e si diffondono.

In un articolo di ricerca per la rivista ResearchIdee e risultati Padilla-Sánchez discute in dettaglio le varianti britannica e sudafricana. Presenta un'analisi computazionale della struttura della glicoproteina picco associata al recettore ACE2 che è mutata. Il suo articolo delinea il motivo per cui queste varianti si legano meglio alle cellule umane.

“Ho analizzato la struttura pubblicata di recentepicco SARS-CoV-2, legato al recettore ACE2, e ha scoperto perché le nuove varianti sono più trasmissibili6, ha detto. "Questi risultati sono stati ottenuti utilizzando il software Chimera della UC San Francisco e simulazioni di dinamica molecolare utilizzando il supercomputer Frontera del Texas Advanced Computing Center (TACC)".

Padilla-Sanchez ha scoperto che la variante britannicaha molte mutazioni nella glicoproteina spike. Ma la cosa più importante è una mutazione, N501Y, nel dominio di legame del recettore che interagisce con il recettore ACE2.

“La mutazione N501Y fornisce risultati molto più elevatiefficienza legante, che a sua volta rende il virus più contagioso. Questa opzione è dominata dal Regno Unito e si sta diffondendo in altri paesi in tutto il mondo ", ha affermato.

La variante sudafricana del coronavirus è apparsa inOttobre 2020 e ha cambiamenti più importanti nello scoiattolo a spillo. Questo lo rende più pericoloso della versione britannica. Include la mutazione chiave E484K. Aiuta il virus a eludere gli anticorpi e le parti del sistema immunitario che potrebbero combattere il coronavirus, sulla base dell'esperienza di una precedente infezione o vaccino. Di conseguenza, il corpo non può combattere il virus.

Padilla-Sánchez ha condotto un'analisi strutturale esaminandostruttura cristallina del virus. Secondo lui, i vaccini attuali non saranno necessariamente efficaci contro le varianti britannica e sudafricana. “Avranno bisogno dei propri vaccini. Avremo bisogno di tanti vaccini quante sono le varianti”, conclude lo scienziato.

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