מהו הזן "הבריטי" של נגיף הקורונה?
זן 202012/01 הוא זן של וירוס SARS-CoV-2 הגורם ל-COVID-19. זֶה
עד אמצע דצמבר המתח החל לעלות במהירותהתפשטות. זה מתאם לעלייה משמעותית בשיעור זיהומי COVID-19 בבריטניה; ההערכה היא שהעלייה הזו נובעת לפחות בחלקה מהמוטציה N501Y בתוך תחום הקולטנים של ה-Spike glycoprotein, הנקשר לקולטן ACE2 בתאים אנושיים.
הזן בולט גם למספר רב של מוטציות בהשוואה למגמת המוטציה הידועה SARS-CoV-2 נכון לדצמבר 2020.
הזן ידוע בכמה שמות. זה מכונה בדרך כלל "הזן הבריטי של COVID-19" ו"הזן הבריטי של נגיף הקורונה" בתקשורת ממשלתית ובתקשורת.
זן זה נקרא בעבר "הזן הראשוןבבדיקה בדצמבר 2020 (VUI - 202012/01) על ידי Public Health England, אך שודרג ל-Strain of Concern על ידי Meera Chand ועמיתיו בדו"ח שפורסם על ידי Public Health England ב-21 בדצמבר 2020.
בדו"ח שנכתב מטעם הקונסורציוםגנומיקה COVID-19 בריטניה (COG-UK) אנדרו רמבו ומחבריו המשותפים התייחסו לזן זה כשושלת B.1.1.7. ה- CDC מכנה גם זן זה 20B / 501Y.V1.
מדינות עם מקרים מאושרים של VOC-2020/12/01
מאיפה הוא הגיע?
כנראה מדרום אפריקה.הדו"ח הראשון על זן זה פורסם על ידי קבוצה של ביולוגים מקומיים בראשות דה אוליביירה ב- 22 בדצמבר 2020 - דגימות נאספו בתחילת אוקטובר. מכיוון שלא בכל המדינות יש תוכניות מעקב אחר זנים חדשים, הגילוי הראשון במדינה אינו מוכיח, כמובן, כי וריאנט מקורו במיקום המדויק בו נמצא.
מאפייני הזן "הבריטי".
- גנטיקה
מוטציות בנגיף SARS-CoV-2 מתרחשות דילעתים קרובות: על פי קונסורציום הגנום COVID-19 של בריטניה (COG-UK), יותר מ -4,000 מוטציות נמצאו בספייק הגליקופרוטאין בלבד בזנים שונים של נגיף זה.
זן VOC-202012/01 מוגדר על ידי 23 מוטציות: 13 מוטציות לא-נרדפות, 4 מחיקות ו -6 מוטציות נרדפות (כלומר 17 מוטציות משנות חלבונים ו -6 לא).
- שידור
גוף הייעוץ המדעי הבריטי NERVTAG(קבוצת ייעוץ בנושא וירוסי נשימה חדשים ומתעוררים) הגיעו למסקנה ב-18 בדצמבר 2020 כי יש להם ביטחון מתון ש-VUI-202012/01 מועבר באופן משמעותי יותר מזנים אחרים, עם נתונים שעדיין אינם מספיקים כדי להגיע למסקנות סופיות לגבי המנגנון הבסיסי של הגברת העברה.
נתונים שהגיעו על ידי NERVTAG הראו כי זהלזן "מקדם בחירה" של 0.70 (70%), בהנחה של מרווח ייצור של 6.5 ימים. עבודה מאוחרת יותר השתמשה במספר היחסי של רפרודוקציות כמדד, המהווה אינדיקטור למקדם הבחירה.
בהתבסס על נתונים מעט שונים, המספר היחסי של רפרודוקציות ("יתרון כפל") נקבע ל-1.74 (משמעות הדבר היא שהזן הזה מועבר ב-74% יותר).
הזן הזה הפך להיות דומיננטי בלונדון, ובמזרח ובדרום מזרח אנגליה למשך חודש עד חודשיים. צמיחה מהירה דומה נצפתה באירלנד, ונראה כי זן זה יהפוך בקרוב לדומיננטי גם שם.
ארה"ב אמורה לעשות את אותו הדברבמרץ. הזינוק בזיהומי SARS-CoV-2 בתחילת השנה החדשה נתפס כתוצאה מההעברה המוגברת של הזן, בעוד ששכיחותם של זנים אחרים פוחתת. זה דורש גבולות הדוקים יותר כדי למנוע עלייה אקספוננציאלית מהירה בזיהומים. בקרת התמסורת של זן זה נראית חלשה יותר ויותר.
תמונה ראשונה של זן וירוס בריטי
האם חיסונים יעילים נגדו?
בעבר פותחו כמה חיסוני COVID-19.
עם זאת, ככל שקורה יותרמוטציות, ייתכן שיהיה צורך לשנות את החיסון. SARS-CoV-2 אינו עובר מוטציה במהירות כמו נגיפי שפעת, למשל, והחיסונים החדשים שהוכחו כיעילים עד סוף 2020 הם סוגים שניתן לשנות במידת הצורך.
נכון לסוף 2020, גופותמומחי בריאות ומומחים מגרמניה, בריטניה ואמריקה סבורים כי החיסונים הקיימים יהיו יעילים כנגד זן VOC-202012/01 כמו נגד הזנים הקודמים.
ב- 18 בדצמבר 2020, NERVTAG הגיע למסקנה כי "כרגע אין מספיק נתונים כדי להסיק מסקנה כלשהי לגבי חוסר הרגישות של זן זה לאנטיגנים לחיסונים."
עד כה שירות הבריאות הציבוריבריטניה אישרה כי אין "שום הוכחה" לכך שהזן החדש יהיה עמיד בפני חיסון Pfizer-BioNTech המשמש כיום בתוכנית החיסונים בבריטניה, ולכן אנשים מחוסנים עדיין מוגנים.
מה מיוחד בזן ה"בריטי"?
באופן כללי, לזן "הבריטי" יש 29 מוטציותלעומת זן ווהאן המקורי. זה מצביע על כך שהוא מוטציה הרבה יותר מהאחרון, שעבורו וירולוגים רשמו כשתי מוטציות בחודש.
יתר על כן, מוטציות רבות שנמצאו בחלבוןקוצים מהזן החדש, מקלים על קשירת הנגיף לקולטני התאים המארחים. לכן, מדענים מציעים כי זן B.1.1.7 יהיה מסוכן יותר - יהיה לו ארסיות גבוהה יותר, ואולי, היכולת להתחמק מפעולת החיסונים המפותחים.
במחקר חדש החליטו המחברים להשתמשהדמיות ממוחשבות כדי לחזות כיצד מוטציות שונות של הזן "הבריטי" ישפיעו על קצב התפשטות וחומרת ההדבקה, כמו גם על שכפול והפתוגנזה של הנגיף עצמו.
כדי להסביר את התדירות הגבוהה ביותר של מוטציות המתרחשות הן בחלבון ה- S ספייק והן בתחום ה- N-terminal, החוקרים מציעים שלושה הסברים:
- זיהום ארוך טווח בנגיף בחולה עם מערכת חיסון מוחלשת אפשר לנגיף להשתנות בקצב גבוה;
- מוטציות אדפטיביות החלו במארחים של בעלי חיים, הועברו לבני אדם באמצעות העברה זואונוטית והמשיכו במארח האדם;
- סלקציה סלקטיבית המתרחשת במבנה הנגיף בלחץ נוגדנים.
תוצאות הסימולציה הראו זאתהיציבות של קשרי מימן בגרסה המוטנטית גבוהה יותר. חלבון הספייק שלו יוצר קשרים נוספים עם הקולטן של תאי המארח, וקשרים אלה נמשכים זמן רב יותר. קצב ההעברה המשוער של זן B.1.1.7 גבוה ב -70% ומספר ההעתקות גבוה ב -0.4 מזה של הגרסה הקלאסית.
הסכנה, לדברי המחברים, טמונה גם בשעל ידי בדיקת סטנדרטים, תגובת שרשרת פולימראז בשעתוק הפוכה, או RT-PCR, עשויה שלא לזהות את ה-RNA הנגיפי של הזן החדש. כמו כן, זן שהשתנה במוטציה עשוי לאפשר לו להתחמק מנטרול על ידי נוגדנים ולהפחית את יעילות החיסונים.
היכן הוא מופץ?
עכשיו - כמעט בכל העולם.על פי המאגר הגדול ביותר של הגנום GISAID, רוב הדגימות המקבילות נמצאו בבריטניה, דנמרק, ארה"ב, צרפת, ספרד ואירלנד, ישנם גנומים אפילו ממדינות משגשגות יחסית כמו ניו זילנד וסינגפור. ניתן לראות את מפות ההפצה כאן.
עם הימצאות המתח ברוסיה, המצב אינו לגמריברור. ב -10 בינואר דיווחה אנה פופובה על גילויה במדינה. עם זאת, במאגר המידע הפתוח הגדול ביותר GISAID של הגנום של גרסה B.1.1.7. מרוסיה לא.
קרא עוד
תסתכל על תמונה של 8 טריליון פיקסלים של מאדים
מדענים פיתחו תחליף לתורת היחסות. מה המהות של "תיאוריית הכל"?
הפלה ומדע: מה יקרה לילדים שילדו