פותחה שיטה חדשה לאיתור גרסת האלפא של SARS-CoV-2 בשפכים

מדענים מקבוצת המחקר הבין-תחומית בנושא עמידות מיקרוביאלית (AMR) ב

בסינגפור, משתפי פעולה מ- Biobot Analytics, האוניברסיטה הטכנולוגית נניאנג (NTU) והמכון הטכנולוגי של מסצ'וסטס פיתחו בהצלחה שיטת חיפוש מולקולרית חדשניתB.1.1.7 (אלפא) SARS-CoV-2.  היא תאפשר ניטור מהיר וזול של וריאנטים אחרים של נגיף הקורונה החדש במי שפכים.

ניטור מי שפכים עוזר במהירות ועוקבים באופן בלתי בולט אחר התפשטות COVID-19. מידע נוסף מאפשר לרשויות הבריאות לעקוב אחר המגיפה ברמה הקהילתית. לאחרונה, נמצאו שברי וירוס SARS-CoV-2 באזורי מגורים בסינגפור כחלק מתוכנית מעקב מי שפכים. מידע זה, יחד עם בדיקות המשך, אפשר למשרד הבריאות במדינה להגיב במהירות למצב.

עם זאת, איתור וריאציות של נגיף הקורונה עםניטור שפכים פחות נפוץ עקב בעיות בטכנולוגיות קיימות. רצף הדור הבא לניטור מי שפכים הוא זמן רב ויקר. הבדיקות גם חסרות רגישות. צוות בינלאומי של מדענים במחקר חדש ביקש להתמודד עם בעיה זו.

במחקר שפורסם בכתב עת מדעי הסביבה & Technology Letters, מדענים מסבירים שיטת זיהוי מולקולרית חדשנית המבוססת על RT-qPCR ספציפי לאלל שמזהה ומכמת את וריאנט B.1.1.7 (אלפא). המבחן שפותח, נבדק ואומת על דגימות שפכים מ-19 קהילות בארה"ב, מסוגל לזהות ולכמת בצורה מהימנה רמות נמוכות של וריאנט B.1.1.7 (אלפא) עם תגובתיות צולבת נמוכה ופרופורציות וריאציות נמוכות כמו 1 אחוז במעורב רקע וירוס SARS. -CoV-2.

ניתן ליישם שיטה המיועדת למוטציות של ספייק חלבון המנבאות את גרסה B.1.1.7 (אלפא) באמצעות פרוטוקולי RT-qPCR זמינים מסחרית.

קרא עוד

האטת סיבוב כדור הארץ גרמה לשחרור חמצן על כדור הארץ

אסטרונומים מזהים מבנים יוצאי דופן בחלל העמוק

ראה עוד אמנות רוק ניאנדרטלית בת 60,000 שנה

AMR - עמידות מיקרוביאלית

RT -qPCR - שעתוק הפוך PCR כמותי.