מהו זן דרום אפריקה של נגיף קורונה?
זן 501. V2, או "זן אפריקאי" או "דרום אפריקאי"
מאפייני הזן
- התפשטות פעילה בקרב צעירים
חוקרים ופקידים אמרו זאתשכיחותו של זן זה הייתה גבוהה יותר בקרב צעירים ללא תחלואה כלשהי, ובהשוואה לזנים אחרים, סביר יותר להניח כי יגרום למחלות קשות במקרים כאלה.
- גורם לסכנה של גל שני במדינות אפריקה
גם משרד הבריאות של דרום אפריקהציין כי זן זה יכול להיות הכוח המניע מאחורי הגל השני של מגיפת ה- COVID-19 במדינה עקב התפשטות הזן מהר יותר מזנים קודמים אחרים של הנגיף.
- מספר גדול של מוטציות
מדענים ציינו כי זן זה מכילמספר מוטציות המאפשרות לו להיצמד ביתר קלות לתאים אנושיים עקב שלוש מוטציות ב-receptor binding domain (RBD) בגליקופרוטאין הספייק של הנגיף: N501Y (חומצת האמינו אספרגין (N) מוחלפת בחומצת האמינו טירוזין (Y) ב- מיקום 501), K417N ו-E484K.
שתיים ממוטציות אלה (E484K ו- N501Y) הן במוטיב קשירת הקולטן (RBM) של תחום קשרי הקולטן (RBD).
המוטציה N501Y נמצאה גם בזן202012/01, מופץ באופן נרחב בבריטניה. שתי מוטציות נוספות שנמצאו ב- 501. V2, E484K ו- K417N, נעדרות במתח הבריטי. בנוסף, 501. V2 חסר את המוטציה 69-70del שנמצאה בזן אחר.
איתור
הזן החדש התגלה על ידי רצףהגנום השלם. מספר רצפים גנומיים משורה זו הוגשו למאגר הרצפים הגנטי של GISAID, למשל הרצף EPI_ISL_678597.
הפצה בינלאומית
ב-23 בדצמבר, מאט הנקוק הכריז על שני אנשיםשנסעו מדרום אפריקה לבריטניה נדבקו ב-501.V2. 28 בדצמבר. זן זה נמצא בשני אנשים בשוויץ ואדם אחד בפינלנד.
ב-29 בדצמבר, הזן זוהה אצל נוסע,מדרום אפריקה ליפן, ומטייל בינלאומי בקווינסלנד, אוסטרליה. ב-30 בדצמבר התגלה הזן בזמביה. ב-31 בדצמבר הוא זוהה גם בצרפת על נוסע שחזר מדרום אפריקה.
ב- 2 בינואר 2021, המקרה הראשון של הידבקות בכךהזן זוהה בדרום קוריאה. אוסטריה דיווחה על המקרה הראשון של זיהום עם זן זה, וכן על ארבעה מקרים של זיהום עם הזן הבריטי ב- 4 בינואר. ב- 8 בינואר 2021 אירלנד דיווחה על 3 מקרים של זן זה, אשר כולם נקשרו לנסיעות מדרום אפריקה.
חוסר רגישות לחיסונים
ב-4 בינואר 2021, דיווח העיתון "טלגרף",שהאימונולוג של אוקספורד סר ג'ון בל מאמין שהזן הדרום אפריקאי החדש הוא "סימן שאלה גדול" מכיוון שהוא עשוי להיות עמיד בפני חיסונים, ובכך להרוס תקוות ולהחליף אותן בפחד.
באותו יום פרופסור לחיסונים שביר מדהיאמר ל-CBS News כי לא בטוח שהזן החדש 501.V2 יוכל "לעקוף" את ההגנה של החיסון, אך הוא מאמין שהוא "עשוי להיות פחות יעיל".
מוטציות נוספות בחלבון הספייק בזן 501.ה-V2s זוהו על ידי פרופסור חבר למיקרוביולוגיה תאית באוניברסיטת רידינג, סיימון קלארק, כגורם מדאיג מכיוון שהם "עשויים להפוך את הנגיף לפחות רגיש לתגובה החיסונית המושרה על ידי החיסון".
לורנס יאנג, וירולוג מאוניברסיטת וורוויק, ציין גם כי מוטציות ספייק מרובות בזן זה "עשויות להוביל למעט בריחה מההגנה החיסונית."
מספר מחקרים מראים כי זן זה התחמק מנוגדן רב-משובט מנטרל המכוון לחלבון הדוקרן SARS-CoV-2.
אוגור סאכין, מנכ"ל BioNTech,אמר כי יש צורך במחקר נוסף כדי להבטיח שהחיסון הנוכחי של החברה פועל כנגד זן 501. V2, אך אם יהיה צורך להתאים את החיסון, החברה תוכל לעשות זאת בעוד כ- 6 שבועות.
ב- 8 בינואר דיווח הגרדיאן כי החיסון נגד פייזר וBioNTech מ- COVID-19 הראה בבדיקות הכוללות 20 בדיקות דם שהוא מסוגל לספק הגנה מפני זן 501. V2. יש צורך במחקר נוסף כדי לקבוע את מידת ההגנה המדויקת.
Moderna מתכננת לבדוק גרסה חדשה של החיסון שלה, ששונתה במיוחד כדי להגן מפני זן 501.V2, שכן Novavax נוקטת באמצעים דומים.
על פי מחקר קליני של חיסון Ad26.COV2.S מאת Johnson & ג'ונסון, יעילותו בדרום אפריקה נמוכה ב-15% מאשר בארה"ב (57% ו-72%, בהתאמה); ההבדל נובע ככל הנראה מהשכיחות של זן 501.V2 בדרום אפריקה.
מחקר נוסף של החיסון (NVX-CoV2373 מבית Novavax) הראה יעילות של 60% (במשתתפים שלילי HIV) בדרום אפריקה, בהשוואה ליעילות של 90% בבריטניה.
על פי רויטרס, החיסון נגד פייזר יעיל רק מעט פחות נגד 501. V2. AstraZeneca מתכננת להתאים את החיסון שלה לזן זה, כאשר חיסון חדש צפוי להיות מוכן עד סתיו 2021.
ב-24 בפברואר 2021, הודיעה Moderna על תחילתם של ניסויים קליניים בגרסה חדשה של החיסון שלה. הגרסה החדשה תוכננה במיוחד כדי להילחם ב-501.V2.
מוטציות זן
מדענים מצאו שמונה מוטציות בחלבון הספייק של זן "דרום אפריקה". חלבון זה אחראי על כניסת הנגיף לתא.
- N501Y
אחת המוטציות הללו, N501Y, קיימת גם ב-הזן "הבריטי" B.1.1.7 וקשור בקשירה משופרת לקולטן האנושי ACE2, אליו מחובר SARS-CoV-2 על פני התא.
- E484K
מוטציה נוספת, E484K, בקשירת הקולטןתחום הנגיף (RBD), קובע את ההתנגדות המוגברת של 501Y.V2 לנטרול נוגדנים, אשר יכולים להשפיע לרעה על יעילותם של חיסוני COVID-19 המכוונים לחלבון הספייק.
Спайковая мутация E484K была связана со случаем זיהום חוזר עם זן 501. V2 SARS-CoV-2 בברזיל, שלדעת החוקרים היה הזיהום הראשון כזה עם זן המכיל מוטציה זו.
היכן מחולק הזן כעת?
וירוס 501.V2 גרם לגל שני של המגיפה בדרום אפריקה, שהגיעה לשיא באמצע ינואר. היא נמצאה בבוצואנה, זמביה, קניה וגמביה, כמו גם בארה"ב, קנדה, אוסטרליה, סין, ישראל וחלקים של מדינות אירופה.
בנוסף, הזן נמצא בשטח רוסיה, עד כה בכמויות בודדות.
קרא עוד
אוראנוס קיבל את מעמדו של כוכב הלכת המוזר ביותר במערכת השמש. למה?
פיזיקאים יצרו אנלוגיה של חור שחור ואישרו את התיאוריה של הוקינג. לאן זה מוביל?
הפלה ומדע: מה יקרה לילדים שילדו