בעבודה החדשה יצרו המחברים רשת עצבית שקובעת איזו צורה יקבל חלבון מסוים.
צורת החלבון מחושבת כעת באמצעותמאיץ חלקיקים, המעניק צילומי תלת מימד של מולקולות חלבון, או בעזרת מחשב-על, המחשב את מבנהם בהתאם לחוקי הכימיה והפיזיקה הקוונטית.
המחברים יצרו את האלגוריתם evoformer, אשרמנסה לקבוע את המבנה של מקטעים בודדים של מולקולות חלבון, המייצגים אותם בצורה של עץ תלת מימדי של גרפים - הפשטה מתמטית המורכבת מסט של עצמים המחוברים בזוגות זה עם זה. Evoformer מחבר אותם זה לזה, בהתבסס על דוגמאות ידועות כבר, ומשנה בהדרגה את מבנה החיבורים ואת מיקום הצמתים, ומתקרב לאופטימום.
לאחר מכן, הם שילבו אלגוריתמים כאלה ויצרו רשת עצבית AlphaFold2.
בשנה שעברה כבר הצגנו את הגרסה הראשונההמערכת שלנו, AlphaFold, שהצליחה לחזות את מבנה החלבונים בדיוק אטומי כמעט כחלק מהתחרות CASP13. כעת יצרנו גרסה חדשה שלו, שעולה באופן ניכר על כל המתחרים במהירות ובדיוק. יתרה מכך, קוד המקור שלו פתוח לחלוטין.
דמיס חסביס, מנכ"ל Deepmind
כתוצאה מכך, הרשת העצבית משחזרת את הצורה התלת מימדית בדיוק אטומי תוך כ-10 דקות, עם שגיאה של 0.096 ננומטר לכל אטום בתוך החלבון.
קרא עוד:
הסביר כיצד היקום משתקף ליד חורים שחורים
הרעלה המונית וגרסאות חדשות למות הציוויליזציה: כיצד השתנה הידע שלנו על המאיה
שינויים במסלול כדור הארץ תרמו להופעתם של חיים מורכבים על פני כדור הארץ