מדענים בחנו למעלה מ -1,000 שילובים של מוטציות בחלבוני קוצים של נגיף כורמון

SARS-CoV-2 התפתח לרכישת מוטציות בחלבון הספייק, החלק של הנגיף שבולט ממנו

משטחים ונצמדים לתאים עבורהַדבָּקָה. מוטציות בחלק זה של נגיף הקורונה מגבירות את יכולתו להיקשר לתאים אנושיים או להתחמק מנוגדנים. מחקר חדש מהמרכזים לגנומיקה וביולוגיה של מערכות באוניברסיטת ניו יורק ובאוניברסיטת ניו יורק באבו דאבי משתמש במודלים ממוחשבים כדי להעריך את המשמעות הביולוגית של מוטציות חלבון ספייק. המטרה היא לזהות גרסאות של הנגיף שנקשרות חזק יותר לקולטן ACE2 או עמידות יותר לנוגדנים.

קרדיט: הין הארק גן וכריסטין גנסאלוס, המחלקה לביולוגיה של ניו יורק.

מדענים מציעים כי המוטציות הללו בחלבון הדוקרן הן הסיבה העיקרית להתפשטות המהירה של הנגיף באזורים מסוימים בעולם.

בחודשים האחרונים, חדשים ועודזנים מדבקים של נגיף העטרה המוביל לגלים חדשים של המגיפה במדינות כמו הודו וברזיל. המצב המחמיר דורש שיטות לחיזוי מהיר של זנים נגיפיים מדבקים חדשים. אך מעקב אחר אפשרויות חדשות אינו משימה קלה; רצף הגנום מראה כי לחלבון הספייק של SARS-CoV-2 לבדו, למשל, יש כ -5,000 גרסאות אפשריות.

הקרנה למגוון רחב כל כך של אפשרויותהמדענים מציינים אתגר עצום לשיטות הניסוי המסורתיות. היתרון בסימולציות ממוחשבות הוא שניתן להעריך בקלות מאה מוטציות תוך מספר ימים.

מדענים פנו לשיטה חישוביתאשר מדגים כיצד חלבון הספייק SARS-CoV-2 מזהה את הקולטן ACE2 - חלבון על פני השטח של סוגי תאים רבים - כדי להיכנס לתאי מארח. עלייה בזיהומים בברזיל, דרום אפריקה, בריטניה והודו.

הערכה שיטתית של האפשרויות הראתה זאתמוטציות ספייק הנקשרות בחוזקה לקולטן ACE2 מתרחשות בשני אשכולות, או "נקודות חמות", של מוטציות בממשק הקישור. הם ממוקמים באזורים גמישים מבנית. משמעות הדבר היא כי מוטציות המגבירות את הכריכה תכנתו מחדש את קונפורמציית עמוד השדרה כדי לשפר את יכולתו לזהות קולטני ACE2.

המחקר פורסם ב- כתב העת לביולוגיה מולקולרית.

קרא גם

מזל"ט אוטונומי של Skyborg של ה- USAF מבצע את הטיסה הראשונה שלו

עש ענק נמצא באוסטרליה. מוטת הכנפיים שלה היא 25 ס"מ

מדענים הפכו בתי בטון לסוללות