廃水中のSARS-CoV-2のアルファ変異体を検出するための新しい方法が開発されました

抗菌薬耐性(AMR)に関する学際的研究グループの科学者

Biobot の従業員がいるシンガポール拠点Analytics、南洋理工大学 (NTU)、および MIT は、SARS-CoV-2 の B.1.1.7 (アルファ) バリアントを分子的に検索する革新的な方法の開発に成功しました。これにより、廃水中の新型コロナウイルスの他の変異種を迅速かつ低コストで監視できるようになる。

廃水モニタリングは、迅速かつCOVID-19の広がりを目立たないように追跡します。追加情報により、保健当局はコミュニティレベルでパンデミックを追跡できます。最近では、SARS-CoV-2ウイルスの断片が、積極的な廃水監視プログラムの一環として、シンガポールの住宅地で発見されています。この情報は、フォローアップテストとともに、国の保健省が状況に迅速に対応することを可能にしました。

ただし、コロナウイルスの亜種の検出既存の技術に問題があるため、廃水モニタリングはあまり一般的ではありません。廃水モニタリングのための次世代シーケンシングは、時間と費用がかかります。テストも感度に欠けています。新しい研究の科学者の国際チームは、この問題に取り組むことを目指しました。

で発表された研究では、ジャーナル 環境科学とTechnology Letters では、B.1.1.7 (アルファ) バリアントを検出および定量する、対立遺伝子特異的 RT-qPCR に基づく革新的な分子検出方法について科学者らが説明しています。開発されたアッセイは、米国の 19 の地域社会からの廃水サンプルでテストおよび検証されており、交差反応性が低く、混合液中の変異体の割合が 1% という低レベルの B.1.1.7 (アルファ) 変異体を確実に検出および定量することができます。 SARS ウイルスの背景。

バリアントB.1.1.7(アルファ)を​​予測するタンパク質スパイク変異を目的とした方法は、市販のRT-qPCRプロトコルを使用して実装できます。

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AMR-抗菌剤耐性

RT-qPCR-定量的PCR逆転写。