発見された研究から削除されたコロナウイルス遺伝子配列

新型コロナウイルスはこれまでに世界で390万人の死者を出している。パンデミックの初めに

SARS-CoV-2の起源に関する調査は、最初に症例が発生した中国からの情報へのアクセス不足によって妨げられている。

現在、シアトルを拠点とする研究者は、武漢でのCOVID-19の初期の症例のいくつかから、13の部分的な遺伝子配列を明らかにするGoogleCloudから削除されたファイルを発見しました。

シーケンスはバランスを崩しませんSARS-CoV-2がどのように発生したかに関する多くの理論から、または由来しています。たとえば、彼らはウイルスが武漢の厳重なセキュリティの研究所から漏洩したという理論を支持していない。しかし、中国地方の海鮮市場で最初の大規模感染が発見される前から、新型コロナウイルスが蔓延していたことを示す証拠がある。

どこでどのように起こったかを正確に特定するウイルスの場合、科学者は他のすべての株が由来するいわゆる前駆体ウイルスを見つける必要があります。これまでのところ、最も初期のシーケンスは、主に武漢の華南シーフードマーケットでの事例から取られています。当初、SARS-CoV-2は2019年12月末に最初に登場したと推測されていました。しかし、その年の12月初旬から11月までの事件は、市場とのつながりがありませんでした。これは、ウイルスが別の場所から発生したことを示しています。

市場で見つかったケースには3つが含まれます数週間後に市場の外で検出されたウイルスサンプルには存在しない変異。突然変異のないウイルスは、馬蹄形のコウモリに見られるコロナウイルスとより密接に一致していました。科学者たちは、新しいコロナウイルスがどういうわけかコウモリに由来することを確信しているので、前駆細胞にもこれらの突然変異がなかったと仮定するのは論理的です。

そして今、医学研究所のジェシー・ブルームシアトルのハワードヒューズは、削除されたシーケンスデータ(おそらくウイルスの最も初期のサンプルからの一部)にもこれらの変異がないことを発見しました。

約1年前、241遺伝子コロナウイルス患者の配列は、国立衛生研究所(NIH)が管理するオンラインデータベースであるSequence ReadArchiveから欠落しています。

ブルームは行方不明のシーケンスに気づきました、2020年5月にPeerJで公開された研究でスプレッドシートに出くわしたとき。それらは武漢大学のプロジェクトPRJNA612766の一部であり、おそらくアーカイブにアップロードされていました。科学者はアーカ​​イブデータベースでシーケンスを検索し、「アイテムが見つかりません」というメッセージを受け取りました。

彼の調査により、削除されたことが明らかになりましたシーケンスは武漢大学病院によって収集されます。同時に、これらのシーケンスに基づいて公開された研究のプレプリントは、エピデミックの開始時にCOVID-19が疑われる外来患者の鼻腔スワブのサンプルから採取されたことを示唆しています。

ブルームは、シーケンスが削除された理由についての説明を見つけることができず、研究の著者への彼の電子メールは返信されませんでした。

科学者は、「説得力のある科学的根拠はない」と述べています。データを削除する理由。」重要なのは、シーケンスが作品内で説明されているサンプルに完全に対応しているということです。文書に修正はありません。さらに、この研究は、サンプルが個人から自発的に得られたものであり、配列決定ではプラスミドの汚染やサンプルの汚染の証拠が示されていないことを強調しています。 「配列はその存在を隠すために削除された可能性が高い」とブルーム氏は結論づけている。

彼の発見を含む記事は、biorxiv プレプリント Web サイトに掲載されました。

続きを読む

歴史上最大の彗星は太陽系に見られます:それはほとんど惑星です

新しい方法は、炭素を即座にグラフェンまたはダイヤモンドに変えます

メガシティの中心部を過熱から救うための安価な方法を見つけました