コロナウイルスの南アフリカ株とは何ですか？
ひずみ501.V2、または 「アフリカ系」または「南アフリカ系」
菌株の特徴
- 若者に積極的に広まる
研究者や関係者はこの菌株の有病率は、併存疾患のない若者の間で高く、他の菌株と比較して、そのような場合に重篤な病気を引き起こす可能性が高くなります。
- アフリカ諸国で第二波の危険を引き起こす
南アフリカの保健省もこの株は、ウイルスの他の初期の株よりも速く広がるため、国内でのCOVID-19パンデミックの第2波の背後にある原動力である可能性があると指摘しました。
- 多数の突然変異
科学者らは、この株には以下の成分が含まれていることを指摘しました。ウイルスのスパイク糖タンパク質N501Yの受容体結合ドメイン（RBD）の3つの変異により、ウイルスがヒトの細胞により容易に付着できるようにするいくつかの変異（アミノ酸のアスパラギン（N）がアミノ酸のチロシン（Y）に置き換わる）位置 501)、K417N、および E484K。
これらの変異のうちの2つ（E484KおよびN501Y）は、受容体結合ドメイン（RBD）の受容体結合モチーフ（RBM）にあります。
N501Y変異はこの菌株でも発見されました202012/01、英国で広く配布されています。 501.V2に見られる他の2つの変異、E484KとK417Nは、英国株には存在しません。さらに、501.V2は別の株に見られる69-70del変異を欠いています。
検出
新しい菌株はシーケンシングによって発見されました完全なゲノム。この系統のいくつかのゲノム配列、たとえば配列EPI_ISL_678597がGISAID遺伝子配列データベースに提出されました。
国際流通
12月23日、マット・ハンコックは2人が南アフリカから英国に旅行した人は501.V2に感染しました。 12月28日。この株はスイスで２人、フィンランドで１人から見つかった。
12月29日に旅行者から株が検出され、南アフリカから日本へ、そしてオーストラリアのクイーンズランド州の海外旅行者から。 12月30日、ザンビアでこの株が発見された。 12月31日にはフランスでも南アフリカから帰国した乗客から感染が検出された。
2021年1月2日、これに感染した最初の症例この株は韓国で確認されました。オーストリアは、1月4日に、この株による最初の感染例と、英国株による4例の感染を報告しました。 2021年1月8日、アイルランドはこの株の3例を報告しましたが、そのすべてが南アフリカからの旅行に関連していました。
ワクチンに対する非感受性
2021年1月4日、テレグラフ紙が報じた。オックスフォードの免疫学者サー・ジョン・ベル氏は、南アフリカの新型株はワクチンに耐性がある可能性があるため「大きな疑問符」であり、それによって希望が打ち砕かれ恐怖に取って代わられると考えているという。
同日、ワクチン学教授のシャビル・マディ氏は、同氏はCBSニュースに対し、新型株501.V2がワクチンの防御を「回避」できるかどうかは定かではないが、「効果は低いかもしれない」と考えていると語った。
501株のスパイクタンパク質に追加の変異。レディング大学の細胞微生物学のサイモン・クラーク准教授は、V2は「ワクチンによって誘発される免疫反応に対するウイルスの感受性を低下させる可能性がある」ため、懸念要因として指摘した。
ウォーリック大学のウイルス学者であるローレンス・ヤングはまた、この株の複数のスパイク変異が「免疫防御からの脱出につながる可能性がある」と述べた。
いくつかの研究は、この株がSARS-CoV-2スパイクタンパク質を標的とする中和マルチクローン抗体を回避したことを示しています。
BioNTechのエグゼクティブディレクターであるUgurSakhin氏は、同社の現在のワクチンが501.V2株に対して機能することを確認するにはさらなる研究が必要であるが、ワクチンを調整する必要がある場合、会社は約6週間で調整できると述べた。
1月8日、ガーディアンはファイザーワクチンとCOVID-19のBioNTechは、20回の血液検査を含むテストで、501.V2株に対する防御を提供できることを示しました。正確な保護の程度を確立するには、さらなる研究が必要です。
モデルナは、ノババックスも同様の措置を講じているため、501.V2株に対する防御のために特別に改良された新バージョンのワクチンを試験する計画だ。
Ad26ワクチンの臨床研究によると。COV2.S by Johnson &ジョンソン氏、アフリカ南部でのその有効性は米国よりも 15% 低いです (それぞれ 57% と 72%)。この違いは、おそらく南アフリカにおける 501.V2 株の蔓延によるものと考えられます。
ワクチン（Novavax社のNVX-CoV2373）に関する別の研究では、英国での有効性が90％だったのに対し、南アフリカでは有効性が60％（HIV陰性参加者において）示された。
ロイターによると、ファイザーワクチンは501.V2に対してわずかに効果が低いだけです。アストラゼネカは、そのワクチンをこの株に適応させることを計画しており、新しいワクチンは2021年秋までに準備が整うと予想されています。
2021年2月24日、モデルナは新バージョンのワクチンの臨床試験の開始を発表した。新しいバージョンは、501.V2 に対抗するために特別に設計されています。
株の突然変異
科学者たちは、「南アフリカ」株のスパイクタンパク質に8つの突然変異を発見しました。このタンパク質は、ウイルスの細胞への侵入に関与しています。
- N501Y
これらの変異の1つであるN501Yは、「英国」株B.1.1.7は、SARS-CoV-2が細胞表面に付着しているヒト受容体ACE2への結合の強化に関連しています。
- E484K
受容体結合における別の突然変異、E484Kウイルスのドメイン（RBD）は、中和抗体に対する501Y.V2の耐性の増加を決定します。これは、スパイクタンパク質を標的とするCOVID-19ワクチンの有効性に悪影響を与える可能性があります。
スパイク変異E484Kはケースにリンクされていますブラジルでの501.V2SARS-CoV-2株による再感染。これは、この変異を含む株による最初のそのような再感染であると研究者は信じています。
菌株は現在どこに分布していますか？
ウイルス501。V2 は南アフリカで流行の第 2 波を引き起こし、1 月中旬にピークに達しました。V2 はボツワナ、ザンビア、ケニア、ガンビアのほか、米国、カナダ、オーストラリア、中国、イスラエル、および一部の地域でも発生しました。ヨーロッパ諸国。
さらに、この株はロシアの領土でこれまでのところ単一の量で発見されました。
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