著者らは、どのように起こるかを予測するソフトウェアを使用してミニ抗体を開発しました。
これはとても素晴らしいものです！それは多くの可能性を開きます。
スティーブン・メイヨ、カリフォルニア工科大学の化学者
抗体はタンパク質によく結合します。さまざまな微生物と一緒に。したがって、製薬会社はこれらを感染症やがんと戦う薬として使用しています。しかし、抗体は大きなタンパク質であるため、製造コストが高く、プロセスが不安定であることがよくあります。研究著者らは、これらの問題を克服するために取り組みました。
抗体が標的に結合するプロセスワシントン大学（UW）の計算構造生物学者であるDavid Bakerは、切り立った崖を登ろうとしているロッククライマーのように見えます。このような岩の表面は通常滑らかで、腕や脚のサポートはほとんどありません。抗体は大きいので、同時に多くのグリップを作り、しっかりと保持することができます。
しかし、ミニ抗体には可能性がほとんどありません。研究者らはこの欠点を克服しようと試み、タンパク質上の捕捉部位を特定し、これに基づいてミニ抗体を構築した。ただし、これはよく研究されたタンパク質に対してのみ機能します。
この問題を回避するために、ベイカーと同僚アミノ酸配列に基づいてタンパク質の構造を予測するために開発したRosettaソフトウェアに目を向けました。潜在的な足場のマップを作成するために、チームは、厳密に定義されたアミノ酸がターゲットタンパク質の表面のさまざまなポイントにどの程度結合するかを計算することをプログラムに課しました。研究者たちはロゼッタを使用して、何万もの仮想ミニ抗体を作成しました。
このソフトウェアは許可しますカリフォルニア大学サンフランシスコ校のバイオエンジニアであるTanyaKortemme氏は、病気を早期に発見するのに役立つ診断プローブを開発する研究者を追加しました。
タンパク質を設計することができます任意のターゲットに連絡してください。これは、ミニタンパク質が病気の原因となるタンパク質をブロックするだけでなく、薬物を癌性組織に向けたり、発光または放射性の診断分子を任意の細胞に送達したりできることを意味します。これは、治療の進捗状況を追跡するのに役立ちます。
Longxin Cao、カリフォルニア大学博士研究員
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