このプロジェクトでは Perturb-seq アプローチを使用しており、オンまたはオフの影響を追跡できます。
Perturb-seqテクノロジーを使用する場合研究者は、CRISPR-Cas9を使用して細胞に遺伝子変化を加え、次に単一細胞RNAシーケンスを使用して、その遺伝子変化の結果として発現されるRNAに関する情報を収集します。研究者たちは、RNAが細胞の挙動のあらゆる側面を制御しているため、この方法は最小限の遺伝子変化による細胞への影響のほとんどを解読するのに役立つと述べています。
新しい研究では、科学者はヒト血液がん細胞株、および網膜由来の非がん細胞は、250万を超える細胞に対してPerturb-seqを実行します。得られたデータに基づいて、遺伝学者は遺伝子型と表現型をリンクする包括的なマップを作成しました。
著者は、プロジェクトの結果が役立つと信じています将来の研究。たとえば、統合マップの作成者自身がデータを使用して、機能が不明な遺伝子の細胞効果を研究し、ストレスに対するミトコンドリアの応答を研究し、染色体の喪失または獲得を引き起こす遺伝子をスクリーニングしました。過去に勉強するのは難しい。
「このデータセットにより、生物学のさまざまな分野から来た人々に対して、私たちがまだ考えもしなかったあらゆる種類の分析が可能になると思います」と、この研究の共著者であるトム・ノーマンは述べています。
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