Frontera は、タンパク質、水、遺伝子を備えた HIV-1 カプシドの最初の現実的なモデルの作成を支援しました。
キャプシドモデル
シカゴ大学の名誉教授であるグレゴリー・ワスは、次のように述べています。「私たちが行った大規模なシミュレーションと分析により、HIV-1ウイルスのキャプシドに脆弱性を見つけることができました。
研究者らは実験データを使用して、HIV-1キャプシドの分子動力学の全原子シミュレーションを開発しました。シミュレーションは1億個の原子で構成されていました。
結果の画像は溝を示しており、それらは応力と変形の過程で現れます。それらは、タンパク質の格子がどこで収縮または拡張するかを理解するために使用できます。
シミュレーションでの溝の位置
このような研究は、最適な戦略に従って作用し、ウイルスの弱点をターゲットにする薬の作成に役立ちます。
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