スーパーコンピューターは、新しいコロナウイルス変異体がより伝染性で致命的である理由を示しています

すべてのウイルスは、拡散するために自分自身をコピーするときに変異します。新型コロナウイルス感染症(COVID-19)の原因となるウイルスであるSARS-CoV-2は、

例外となった。現在、新型コロナウイルス感染症には 4,000 種類以上の亜種があり、パンデミック中にすでに世界中で 270 万人以上が死亡しています。

B.1.1としても知られる英国の変種。7、2020年9月に最初に発見され、現在、英国のすべてのCOVID-19症例の98%を引き起こしています。また、フランス、デンマーク、米国など、約100か国に広がっています。

世界保健機関は言いますそのB.1.1.7は、南アフリカとブラジルで出現している他の選択肢と同様に、懸念されるいくつかの選択肢の1つです。 「英国、南アフリカ、ブラジルのウイルスの亜種は、元のウイルスよりも感染性が高く、免疫を取り除くのが簡単です」と、アメリカカトリック大学の研究員であるビクターパディーラサンチェスは説明します。 「なぜ彼らがより感染性が高く、多くの場合より致命的であるのかを理解する必要があります。」

3つのバリアントはすべて、スパイクタンパク質(ヒト細胞に付着するウイルスの一部)が変化しています。その結果、それらは細胞への感染と拡散を改善します。

Research誌の研究記事にてアイデアと結果 Padilla-Sánchez が英国と南アフリカの亜種について詳しく説明します。彼は、変異した ACE2 受容体関連スパイク糖タンパク質の構造のコンピューター解析を発表しました。彼の論文は、これらの変異体がヒトの細胞によく結合する理由を概説しています。

「最近公開された構造を分析しましたACE2受容体に結合したSARS-CoV-2をスパイクし、新しい変異体がより伝染しやすい理由を発見した6と彼は述べた。 「これらの結果は、カリフォルニア大学サンフランシスコ校のキメラソフトウェアと、テキサスアドバンストコンピューティングセンター(TACC)のFronteraスーパーコンピューターを使用した分子動力学シミュレーションを使用して得られました。」

Padilla-Sanchezは、英国の亜種がスパイク糖タンパク質に多くの変異があります。しかし、最も重要なのは、ACE2受容体と相互作用する受容体結合ドメインの1つの変異N501Yです。

「N501Y変異ははるかに高い結合効率。これにより、ウイルスの感染性が高まります。このオプションは英国によって支配されており、世界中の他の国に広がっています」と彼は言いました。

コロナウイルスの南アフリカの亜種が登場2020年10月、スパイクリスにさらに重要な変更が加えられました。これにより、英国版よりも危険になります。キーミューテーションE484Kが含まれています。これは、以前の感染またはワクチンの経験に基づいて、ウイルスがコロナウイルスと戦う可能性のある抗体および免疫系の一部を回避するのに役立ちます。その結果、体はウイルスと戦うことができません。

パディラ・サンチェスは次のことを調べて構造分析を実施しました。ウイルスの結晶構造。同氏によると、現在のワクチンは英国や南アフリカの変異種に対して必ずしも有効ではないという。 「彼らは独自のワクチンを必要とするでしょう。変異体の数だけワクチンが必要になるだろう」と科学者は結論づけている。

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