항생제 내성(AMR)에 관한 학제간 연구 그룹의 과학자들
폐수 모니터링은 신속하고COVID-19의 확산을 눈에 띄지 않게 추적합니다. 추가 정보를 통해 보건 당국은 지역사회 수준에서 전염병을 추적할 수 있습니다. 보다 최근에는 사전 예방적 폐수 감시 프로그램의 일환으로 싱가포르의 주거 지역에서 SARS-CoV-2 바이러스 조각이 발견되었습니다. 이 정보와 후속 테스트를 통해 국가 보건부는 상황에 신속하게 대응할 수 있었습니다.
그러나 코로나바이러스의 변종 검출폐수 모니터링은 기존 기술의 문제로 인해 덜 일반적입니다. 폐수 모니터링을 위한 차세대 시퀀싱은 시간과 비용이 많이 듭니다. 테스트는 또한 감도가 부족합니다. 새로운 연구에서 국제 과학자 팀이 이 문제를 해결하려고 했습니다.
에 발표된 연구에서저널 Environmental Science & Technology Letters에서 과학자들은 B.1.1.7(알파) 변종을 검출하고 정량화하는 대립유전자 특이적 RT-qPCR을 기반으로 한 혁신적인 분자 검출 방법을 설명합니다. 미국 19개 지역사회의 폐수 샘플에 대해 테스트 및 검증된 개발된 분석법은 교차 반응성이 낮고 변형 비율이 혼합된 환경에서 1% 정도로 낮은 수준의 B.1.1.7(알파) 변종을 안정적으로 검출하고 정량화할 수 있습니다. SARS 바이러스 배경 -CoV-2.
변형 B.1.1.7(알파)을 예측하는 단백질 스파이크 돌연변이를 목표로 하는 방법은 상업적으로 이용 가능한 RT-qPCR 프로토콜을 사용하여 구현할 수 있습니다.
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AMR - 항균제 내성
RT-qPCR - 정량적 PCR 역전사.