연구에서 제거 된 코로나 바이러스 유전자 서열 발견

현재까지 새로운 유형의 코로나바이러스로 인해 전 세계적으로 390만 명이 사망했습니다. 대유행 초기에

SARS-CoV-2의 기원에 대한 조사는 사례가 처음 등장한 중국의 정보에 대한 접근 부족으로 인해 방해를 받았습니다.

이제 시애틀에 본사를 둔 한 연구원은 우한에서 발생한 COVID-19의 초기 사례 중 일부에서 13 개의 부분 유전 서열을 드러내는 Google Cloud에서 삭제 된 파일을 발견했습니다.

시퀀스는 균형을 무너뜨리지 않습니다.SARS-CoV-2가 어떻게 발생했는지에 대한 많은 이론에서 나온 것입니다. 예를 들어, 그들은 우한의 보안이 철저한 실험실에서 바이러스가 유출되었다는 이론을 지지하지 않습니다. 그러나 증거에 따르면 중국 지방의 한 해산물 시장에서 첫 번째 대규모 발병이 발견되기 전에도 새로운 코로나바이러스가 퍼지고 있었음을 시사합니다.

정확히 어떻게 그리고 어디서 일어 났는지과학자들은 다른 모든 균주가 유래 한 이른바 전구체 바이러스를 찾아야합니다. 지금까지 가장 초기의 시퀀스는 대부분 우한의 Huanan 해산물 시장의 사례에서 가져 왔습니다. 원래 SARS-CoV-2가 2019 년 12 월 말에 처음 등장한 것으로 추측되었습니다. 그러나 그해 12 월 초부터 11 월까지의 사례는 시장과 관련이 없었습니다. 이것은 바이러스가 다른 위치에서 시작되었음을 나타냅니다.

시장에서 발견되는 케이스는 3 개를 포함합니다바이러스 샘플에없는 돌연변이는 몇 주 후에 시장 밖에서 발견되었습니다. 돌연변이가없는 바이러스는 말굽 박쥐에서 발견되는 코로나 바이러스와 더 가깝게 일치했습니다. 과학자들은 새로운 코로나 바이러스가 어떻게 든 박쥐에서 비롯된 것이라고 확신하므로 선조에도 이러한 돌연변이가 없다고 가정하는 것이 합리적입니다.

그리고 지금 의학 연구소의 Jesse Bloom시애틀의 Howard Hughes는 삭제 된 서열 데이터 (아마도 바이러스의 초기 샘플에서 일부)에도 이러한 돌연변이가 없음을 발견했습니다.

약 1 년 전, 유전 241 개코로나 바이러스 환자의 시퀀스가 ​​NIH (National Institutes of Health)에서 관리하는 온라인 데이터베이스 인 시퀀스 읽기 아카이브에서 누락되었습니다.

Bloom은 누락 된 시퀀스를 발견했습니다.2020 년 5 월 PeerJ에서 발표 된 연구에서 스프레드 시트를 우연히 발견했습니다. 그들은 Wuhan University 프로젝트 PRJNA612766의 일부였으며 아카이브에 업로드 된 것으로 추정됩니다. 과학자는 아카이브 데이터베이스에서 시퀀스를 검색하고 "항목을 찾을 수 없습니다."라는 메시지를 받았습니다.

그의 조사에 따르면서열은 우한 대학 병원에서 수집합니다. 동시에, 이러한 시퀀스를 기반으로 발표 된 연구의 사전 인쇄는 유행 초기에 COVID-19가 의심되는 외래 환자의 코 면봉 샘플에서 채취했음을 시사합니다.

Bloom은 시퀀스가 ​​제거 된 이유에 대한 설명을 찾을 수 없었고 연구 저자에게 보낸 이메일에 응답하지 않았습니다.

과학자는 “확실한 과학적 근거는 없다”고 지적합니다.데이터 삭제 이유." 요점은 시퀀스가 ​​작업에 설명된 샘플과 완전히 일치한다는 것입니다. 문서에 수정사항이 없습니다. 또한, 연구에서는 샘플이 개인으로부터 자발적으로 채취되었으며, 서열분석 결과 플라스미드 오염이나 샘플 오염의 증거가 없음을 강조합니다. Bloom은 “그 존재를 숨기기 위해 시퀀스가 ​​제거된 것 같습니다.”라고 결론지었습니다.

그의 연구 결과가 포함된 기사가 biorxiv 사전 인쇄 웹사이트에 게시되었습니다.

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