Инструмент, разработанный командой, называется CShaper.
Это мощный вычислительный инструмент, который может
систематически сегментировать и анализировать изображения клеток на уровне конкретных представителей. Это очень важно для изучения деления клеток, а также функций клеток и генов.작업 텍스트
Для того, чтобы создать вычислительное устройство, биологи изучали, как животные вырастают из единственной клетки, оплодотворенной яйцеклетки или посредством бесчисленных клеточных делений. В частности они хотели знать определенные функции генов, например, какие гены участвуют в делении клеток при формировании различных органов или что вызывает аномальные деления клеток, из-за которых вырастают опухоли.
Для этого исследователи сначала получили изображения клеток — их «генеалогическое древо». Затем они «отключают» (удаляют) ген из последовательности ДНК и сравнивают два дерева родословных, чтобы проанализировать изменения в клетках и сделать вывод о функциях генов. После этого эксперимент повторяется, но уже с другими генами.
생물 학자들은 연구에서 배아를 사용했습니다.Caenorhabditis elegans는 인간과 많은 생물학적 특성을 공유하는 벌레의 한 유형이므로 인간의 종양 성장을 연구하는 데 사용할 수 있습니다.
«Учитывая, что у C. elegans около 20 000 генов, это означает, что потребуется почти 20 000 экспериментов, если вы выберете по одному гену за раз. Это будет огромное количество данных. Поэтому крайне важно использовать автоматизированную систему анализа изображений, которую мы разработали», — текст исследования.
세포 이미지는 일반적으로레이저 빔으로 스캐닝. 기존 이미지 분석 시스템은 세포핵을 성공적으로 감지 할 수만 있지만 세포막의 이미지 품질이 좋지 않아 세포 모양을 재구성하기가 어렵습니다.
Кроме того, отсутствует надежный алгоритм для сегментации покадровых трехмерных изображений (то есть четырехмерных изображений) деления клеток. Сегментация изображения — это важный процесс в компьютерном зрении, который включает в себя разделение визуального ввода на сегменты для упрощения анализа изображения. Но исследователям приходится тратить сотни часов, вручную маркируя множество изображений клеток.
Новая разработка CShaper может обнаруживать клеточные мембраны, создавать формы клеток в трехмерном пространстве и, что более важно, автоматически сегментировать изображения клеток на уровне клеток.
더 읽어보기
위험한 기후 온난화는 7 년 후에 시작됩니다
낙태와 과학 : 출산 할 아이들에게 일어날 일
허블의 가장 아름다운 사진을 확인하세요. 30 년 동안 망원경은 무엇을 보았습니까?