Buvo sukurtas naujas SARS-CoV-2 alfa varianto aptikimo nuotekose metodas

Mokslininkai iš tarpdisciplininės antimikrobinio atsparumo (AMR) tyrimų grupės

Vieta Singapūre su „Biobot“ darbuotojais„Analytics“, Nanyang technologijos universitetas (NTU) ir MIT sėkmingai sukūrė naujovišką metodą, leidžiantį molekuliniu būdu ieškoti SARS-CoV-2 B.1.1.7 (Alfa) varianto.  Tai leis greitai ir nebrangiai stebėti kitus naujo tipo koronaviruso variantus nuotekose.

Nuotekų stebėjimas padeda greitai irnepastebimai stebint COVID-19 plitimą. Papildoma informacija leidžia sveikatos priežiūros institucijoms stebėti pandemiją bendruomenės lygiu. Visai neseniai SARS-CoV-2 viruso fragmentai buvo rasti Singapūro gyvenamuosiuose rajonuose, vykdant aktyvią nuotekų stebėjimo programą. Ši informacija kartu su tolesniais bandymais leido šalies sveikatos ministerijai greitai reaguoti į susidariusią situaciją.

Tačiau nustatant koronaviruso variantus sunuotekų stebėjimas yra retesnis dėl esamų technologijų problemų. Naujos kartos nuotekų stebėjimo seka yra daug laiko reikalaujanti ir brangi. Testams taip pat trūksta jautrumo. Tarptautinė mokslininkų komanda naujame tyrime siekė išspręsti šią problemą.

Tyrime, paskelbtame mžurnalas Aplinkos mokslas ir amp; Technologijos laiškuose mokslininkai paaiškina naujovišką molekulinio aptikimo metodą, pagrįstą aleliui specifiniu RT-qPCR, kuris aptinka ir kiekybiškai įvertina B.1.1.7 (Alfa) variantą. Sukurtas tyrimas, išbandytas ir patvirtintas naudojant nuotekų mėginius iš 19 JAV bendruomenių, gali patikimai aptikti ir kiekybiškai įvertinti žemą B.1.1.7 (Alfa) varianto lygį, kurio kryžminė reakcija yra maža, o variantų proporcijos mišrioje yra tik 1 proc. SARS viruso fonas. -CoV-2.

Metodas, skirtas baltymų smaigalių mutacijoms, numatančioms B.1.1.7 variantą (alfa), gali būti įgyvendintas naudojant komerciškai prieinamus RT-qPCR protokolus.

Skaityti daugiau

Žemės sukimosi sulėtėjimas sukėlė deguonies išsiskyrimą planetoje

Astronomai gilioje erdvėje pastebi neįprastas struktūras

Pamatykite daugiau 60 000 metų senumo neandertaliečių roko meną

AMR - atsparumas antimikrobinėms medžiagoms

RT -qPCR - kiekybinė PGR atvirkštinė transkripcija.