AI padeda atpažinti senovės virusų RNR liekanas žmogaus genome

Ankstesni tyrimai parodė, kad virusui patekus į žmogaus (ir kitų gyvūnų) organizmą, jis

 gali pakeisti šeimininko DNR pridėję dalįsavo RNR. Taip pat žinoma, kad senovės virusai, užkrėsti populiaciją prieš daugelį metų, kartais palikdavo savo RNR likučius žmogaus genome. Tačiau juos rasti pasirodė sudėtinga užduotis, nes reikėjo atlikti daugybę palyginimų kiekvienam „įtariamam“ virusui. Naujajame darbe tyrėjai naudojo mašininio mokymosi algoritmą, kad išspręstų problemą.

Norėdami apmokyti algoritmą, mokslininkai naudojo RNR išžinomi neretrovirusiniai endogeniniai RNR virusiniai elementai. Mokydama šiuolaikinės virusinės RNR algoritmą, sistema galėtų pajusti, kaip ji atrodo kaip visuma. Tyrėjai mano, kad tokie panašumai tikriausiai egzistavo ir senovės RNR. Po mokymų mokslininkai patobulino sistemą, kad išvengtų kuo daugiau klaidingų teigiamų rezultatų. Tada jie paleido jį ant žmogaus genomo ir rado apie 100 tolesnio svarstymo variantų. Išnagrinėję juos, mokslininkai nustatė, kad daugelis jų jau buvo žinomi, o kai kurie buvo žemiau ribos, kurią jie nustatė kaip pasirinkimo variantą. Jiems liko tik vienas galimas nežinomo viruso likutis.

Vėliau mokslininkai patikrino, ar rado tą patįlikusi virusinė RNR kitų rūšių, tokių kaip beždžionės ir šimpanzės, genomuose. Šis atradimas rodo, kad infekcija ir tolesnė DNR pakitimai įvyko mažiausiai prieš 43 milijonus metų.

Tyrėjai pažymėjo, kad daugiau informacijos apie senovės virusus ir jų poveikį žmogaus genomui suteiks supratimą apie vis dar nežinomus šiuolaikinių virusų elgesio niuansus.

Skaityti daugiau

Abortas ir mokslas: kas nutiks gimdantiems vaikams

Radarai rado paskutinį Tlingito fortą Aliaskoje. Jie jo ieškojo daugiau nei 100 metų

Trečdalis atsigavusių po COVID-19 grįžta į ligoninę. Kas aštuntas - miršta