Iki šiol naujo tipo koronavirusas visame pasaulyje nusinešė 3,9 mln. Pandemijos pradžioje
Dabar Sietle dirbantis tyrėjas atrado ištrintus failus iš „Google Cloud“, kurie atskleidžia 13 dalinių genetinių sekų iš kai kurių ankstyviausių COVID-19 atvejų Wuhane.
Sekos nekeičia pusiausvyrosiš daugelio teorijų apie tai, kaip atsirado SARS-CoV-2. Pavyzdžiui, jie nepalaiko teorijos, kad virusas nutekėjo iš itin saugios laboratorijos Uhane. Tačiau įrodymai rodo, kad naujasis koronavirusas plito dar prieš tai, kai Kinijos provincijos jūros gėrybių turguje buvo aptiktas pirmasis didelis protrūkis.
Tiksliai nustatyti, kaip ir kur nutikovirusas, mokslininkai turi rasti vadinamąjį pirmtako virusą, iš kurio kilo visos kitos padermės. Iki šiol ankstyviausios sekos dažniausiai buvo paimtos iš atvejų Huanano jūros gėrybių turguje Wuhane. Iš pradžių buvo spėjama, kad SARS-CoV-2 pirmą kartą pasirodė 2019 m. Gruodžio pabaigoje. Tačiau atvejai nuo tų metų gruodžio pradžios iki lapkričio neturėjo jokio ryšio su rinka. Tai rodo, kad virusas atsirado iš kitos vietos.
Rinkoje rasta trijų atvejųmutacijų, kurių nėra virusų mėginiuose, aptiktose savaitėmis vėliau už rinkos ribų. Virusai be mutacijų labiau prilygo koronavirusams, rastiems pasagos šikšnosparniuose. Mokslininkai įsitikinę, kad naujasis koronavirusas kažkokiu būdu atsirado iš šikšnosparnių, todėl logiška manyti, kad pirmtakas taip pat neturėjo šių mutacijų.
O dabar Jesse Bloom iš Medicinos institutoHowardas Hughesas iš Sietlo atrado, kad ištrintuose sekos duomenyse (tikriausiai kai kuriuose iš ankstyviausių viruso mėginių) taip pat nebuvo šių mutacijų.
Maždaug prieš metus 241 genetinissergančiųjų koronavirusu seka dingo iš internetinio „Sequence Read Archive“, kurį tvarko Nacionaliniai sveikatos institutai (NIH).
Bloomas pastebėjo trūkstamas sekas,kai 2020 m. gegužės mėn. paskelbtame tyrime „PeerJ“ užklupau skaičiuoklę. Jie buvo Wuhano universiteto projekto PRJNA612766 dalis ir neva buvo įkelti į archyvą. Mokslininkas archyvo duomenų bazėje ieškojo sekų ir gavo pranešimą „Elementai nerasti“.
Jo tyrimas parodė, kad ištrintasekas surenka Wuhano universitetinė ligoninė. Tuo pačiu metu, remiantis šiomis sekomis, paskelbto tyrimo leidinys rodo, kad jie buvo paimti iš nosies tamponų mėginių iš ambulatorinių pacientų, kuriems epidemijos pradžioje buvo įtariama COVID-19.
Bloomui nepavyko rasti jokio paaiškinimo, kodėl sekos buvo pašalintos ir neatsakyta į jo elektroninius laiškus tyrimo autoriams.
Mokslininkas pažymi, kad „nėra įtikinamo mokslinioduomenų ištrynimo priežastys“. Esmė ta, kad sekos visiškai atitinka darbe aprašytus pavyzdžius. Dokumente nėra pataisymų. Be to, tyrime pabrėžiama, kad mėginiai buvo paimti savanoriškai iš asmenų, o sekos nustatymas nerodo užteršimo plazmidėmis ar mėginių užteršimo įrodymų. „Atrodo, tikėtina, kad sekos buvo pašalintos siekiant nuslėpti jų egzistavimą“, - daro išvadą Bloom.
Straipsnis su jo išvadomis buvo paskelbtas biorxiv preprint svetainėje.
Skaityti daugiau
Didžiausia istorijoje kometa matoma Saulės sistemoje: tai beveik planeta
Naujas metodas akimirksniu paverčia anglį grafenu arba deimantais
Rastas nebrangus būdas sutaupyti megapolių centrus nuo perkaitimo