Koronaviruso mutacijos: penki iš šešių potipių yra labiau užkrečiami

Modelį sukūrė pagrindinis tyrėjas Guowei Wei, Matematikos, biochemijos ir katedros profesorius.

molekulinė biologija, analizuojamagenotipą SARS-CoV-2 iš daugiau nei 20 000 viruso genomo mėginių. Tyrėjai taip pat ištyrė spygliuočių baltymo – baltymo, kuris pirmiausia atsakingas už infekcijos plitimą – mutacijas ir nustatė, kad penki iš šešių žinomų viruso potipių dabar yra labiau užkrečiami.

Kaip ir bet kurio viruso atveju, daugybė mutacijųgaliausiai gerybinis, rizika užsikrėtusiems pacientams yra nedidelė arba jos visai nėra. Kai kurios mutacijos netgi sumažina užkrečiamumą. Tačiau kai kurie iš jų virusą daro labiau užkrečiamą.

Wei ir jo komanda keletą mėnesių tyrė ir analizavo mutacijų modelius ir vietas, stebėdami pokyčius iš sausio mėnesį gautos oficialios viruso genomo imties.

Žinios apie SARS-CoV-2 užkrečiamumą yragyvybiškai svarbu užkirsti kelią COVID-19 ir atkurti pasaulio ekonomiką. Pagrindinis klausimas yra tai, kokia šių mutacijų reikšmė COVID-19 perdavimui, diagnozavimui, prevencijai ir gydymui.

Guowei Wei, Matematikos, biochemijos ir molekulinės biologijos katedros profesorius

Virusinė infekcija atsiranda, kai smaigalysbaltymas sąveikauja su žmogaus ląstelės-šeimininkės receptoriumi, angiotenziną konvertuojančiu fermentu 2, sutrumpintai ACE2. Kalbant apie ACE2, mokslininkams kelia susirūpinimą sąvoka, vadinama jungimosi afinitetu, arba jungiamosios sąveikos tarp smaigalio baltymo ir šeimininko receptoriaus stiprumas ankstyvosiose infekcijos stadijose.

Viruso užkrečiamumas padidėja, jeirišimosi afinitetas didėja. Tyrėjas paaiškina, kad dabar nustatyta daugiau nei 50 mutacijų, taip pat pririšamų baltymų - trumpai RBD - receptorių surišančio domeno jungiamoji sąsaja, turinti 194 galimas mutacijų vietas.

Wei mašininio mokymosi modelis, pažangusNeuroninis tinklas išanalizavo daugiau kaip 8000 baltymų sąveikos įrašų, kad būtų nustatytas dabartinių žinomų mutacijų poveikis SARS-CoV-2 smaigalio baltymo rišimosi afinitetui. Rezultatas, kuris pasiūlė padidėjusį prisijungimo afinitetą penkiuose iš šešių žinomų potipių, parodė, kad užkrečiamumas gali padidėti dėl mutacijų.

Susirūpinęs tolesnių mutacijų galimybe, Wei ir jo komanda kreipėsi į savo ateities modelį.

Nepaprastai svarbu žinoti, ar ateitis tapsSARS-CoV-2 potipiai kelia tiesioginę grėsmę visuomenės sveikatai. Šiuo tikslu atlikome visų galimų 3686 būsimų mutacijų sistemingą atranką 194 galimų mutacijų palei UBR vietas.

Guowei Wei, Matematikos, biochemijos ir molekulinės biologijos katedros profesorius

Wei modelis prognozuoja, kad daugybė receptorių surišimo motyvo - RBD srities komponento - liekanų turi didelę galimybę mutuotis į labiau infekcines COVID-19 padermes.

Jis perspėja, kad nors prognozės pagrįstosapie dirbtinį intelektą atitinka turimus eksperimentinius duomenis, reikia tolesnių tyrimų, kad būtų galima visiškai suprasti mutacijų poveikį COVID-19 užkrečiamumui.

Kaip savo tyrimo dalį Wei ir jo komandaPrognozuojama, kad naujasis koronavirusas, plintantis visame pasaulyje, taip pat bus šiek tiek infekciškesnis nei pirminis SARS virusas, atrastas 2003 m.

Wei teigė, kad rezultatai yra tokie patys kaipkito eksperimento, kurį neseniai paskelbė mokslininkai iš Scripps tyrimų instituto Floridoje, rezultatai. Šis tyrimas ištyrė baltymų šuolių mutacijas in vitro ir nustatė, kad virusas mutavo taip, kad padidėjo jo užkrečiamumas.

Taip pat skaitykite

Kodėl mokslininkai taip domisi Ceresu? Viskas apie planetą, kurioje jie aktyviai ieško gyvenimo

Rusijoje suprojektuotas „nesunaikinamas“ dronas

Supernovos sprogimas galėjo sukelti masinį žemės išnykimą