Mirtina evoliucija: iš kur atsiranda nauji COVID-19 variantai, kurie yra pavojingiausi

Kaip atsiranda deformacijos

Virusai dauginasi tik gyvos ląstelės viduje, naudodami jos išteklius. Už tai jie

jums reikia padvigubinti RNR.Tai sudėtingas kelių etapų procesas, kurio metu atsiranda klaidų. Būdingiausi yra nukleotidų persirikiavimas, vienų keitimas kitais. Tai vadinama taškine mutacija. Kai RNR yra dubliuojama, mažos sekos gali būti prarastos arba, atvirkščiai, įterptos.

Pasaulyje nėra visuotinai priimtos nomenklatūrosštamų pavadinimai ir naudojami pavadinimai yra gana savavališki. Paprastai jie susideda iš atskirų raidžių ir skaičių, kurie rašomi po rūšies pavadinimo. Pavyzdžiui, viena garsiausių E. coli padermių yraE. coliK−12.

Virusas bando ištaisyti replikacijos gedimus, bet ne visada sėkmingai. Jei mutacija suteikia patogenui bet kokį gyvenimo pranašumą, ji gali įsitvirtinti.

Bakterijų padermės kolonijosJersinijaant agaro-agaro paviršiaus

Šiuo metu žinoma, kad SARS-CoV-2kaupia mutacijas maždaug tokiu pat greičiu, kaip ir gripo sukėlėjas. Naujo tipo koronaviruso genomo mutacijos beveik visada atsiranda ne dėl atsitiktinių klaidų kopijavimo metu, kaip ir daugelio kitų virusų, bet dėl ​​sugadinimo ar netinkamo jau baigtos viruso RNR kopijos redagavimo.

Kaip randamos naujos COVID-19 padermės

Iš pacientų paimami gleivinės mėginiai irdekoduoti patogeno genomą. Ši informacija įkeliama į įprastas duomenų bazes ir palyginama. Pavyzdžiui, GISAID duomenų bazėje yra daugiau nei du milijonai koronaviruso genomų iš viso pasaulio. Yra sekimo priemonė, kuri vizualizuoja, kuri parinktis buvo nustatyta kurioje šalyje.

Iki sausio 16 dienos „Rospotrebnadzor“ pranešė, kad sugalvojo specialų testą, pagal kurį būtų galima nustatyti britų padermę. Rezultatą jis parodys praėjus 1,5 valandos po to, kai žmogus paėmė tepinėlį.

Reikalingi išsamesni ir sudėtingesni bandymaipasakyti, kokią įtampą turi pacientas. Dabar [naudodami PGR testus] galite sužinoti, ar žmogus turi aktyvų virusą – ar yra tam tikras COVID-19 variantas, ar ne. Bet tai nereiškia, kad iš viso neįmanoma nustatyti konkrečios padermės, tiesiog reikia daugiau laiko ir pinigų. 

Aleksejus Agranovskis, Maskvos valstybinio universiteto profesorius ir biologijos mokslų daktaras

Todėl Rusijoje sužinokite, kiek žmoniųužsikrėtė koronavirusu su tam tikra mutacija, kol kas tai neįmanoma, bet tai galima padaryti  atsitiktiniai testai, siekiant suprasti, kaip plačiai paplitusi konkreti X padermė. 

„CoVariants“ svetainėje, naudodami GISAID duomenis, galite pamatyti, kurios mutacijos išskiria tam tikro varianto genomą. Taigi, delta variantas turi keturias reikšmingas smaigalinio baltymo mutacijas ir dvi delecijas.

Pavojingiausi COVID-19 variantai

PSO kaip pavojingus priskyrė keturis variantus: alfa, beta, gama ir delta. 

  • Alfa

Padermė pirmą kartą buvo aptikta 2020 m. spalį per COVID-19 pandemiją JK iš mėginio, paimto praėjusį mėnesį.

Nuo tada jo galimybės dominuoti padvigubėjokas 6,5 dienos (manomas generavimo intervalas). Tai koreliuoja su reikšmingu COVID-19 infekcijų padidėjimu JK. 

Yra tam tikrų įrodymų, kad šio varianto užkrečiamumas padidėja 30–70 proc., o preliminarūs tyrimai rodo, kad padidėja mirtingumas. 

Tačiau atsitinka daugiaumutacijų, vakciną gali tekti keisti. SARS-CoV-2 nemutuoja taip greitai, kaip, pavyzdžiui, gripo virusai, o naujosios vakcinos, kurios buvo veiksmingos iki 2020 m. pabaigos, yra rūšys, kurias prireikus galima modifikuoti.

Nuo 2020 m. Pabaigos įstaigossveikatos ekspertai ir ekspertai iš Vokietijos, Jungtinės Karalystės ir Amerikos mano, kad esamos vakcinos bus tokios pat veiksmingos prieš LOJ-202012/01 padermę, kaip prieš ankstesnes štamas.

  • Beta

Kaip pranešama, padermė pirmą kartą buvo aptikta Pietų Afrikoje2020 m. gruodžio 18 d. pranešė Pietų Afrikos sveikatos departamentas. Tyrėjai ir pareigūnai teigė, kad šios padermės paplitimas buvo didesnis tarp jaunų žmonių, neturinčių jokių pagrindinių sveikatos sutrikimų, ir, palyginti su kitomis padermėmis, tokiais atvejais ji dažniau sukelia sunkias ligas. 

Mokslininkai pažymėjo, kad šioje padermėje yra keletas mutacijų, leidžiančių lengviau prisitvirtinti prie žmogaus ląstelių.

2021 m. Sausio 8 d. „The Guardian“ paskelbė, kad skiepijama„Pfizer“ ir „COVID-19 BioNTech“, atlikdami 20 kraujo tyrimų, parodė, kad jis gali apsaugoti nuo 501.V2 padermės. Norint nustatyti tikslų apsaugos laipsnį, reikia atlikti tolesnius tyrimus.

2021 m. Vasario 24 d. „Moderna“ kompanija paskelbė apie naujos vakcinos versijos klinikinių tyrimų pradžią. Naujoji versija yra specialiai sukurta 501.V2.

  • Gama

Šis štamas pirmą kartą buvo atrastas Tokijuje 2021 m. Sausio 6 dmetų Nacionalinis infekcinių ligų institutas (NIID). Naujas štamas buvo aptiktas keturiems žmonėms, atvykusiems į Tokiją iš Amazonos valstijos 2021 m. Sausio 2 d.

Naujas štamas pirmą kartą pasirodė liepos mėnesį ir buvo pirmasisbuvo atrastas spalio mėn., tačiau paskelbimo metu (2020 m. gruodžio mėn.), nors jo dažnis labai padidėjo, vis dėlto daugiausia buvo platinamas tik Rio de Žaneiro valstijos sostinėje.

Smaigo baltymo K417T mutacija buvo nauja, leidžiantivirusas stipriau jungiasi prie žmogaus ląstelių, o kai kuriais atvejais netgi vengia antikūnų. Be to, virusas stipriau nei originalas užkrečia jaunus žmones ir nėščias moteris.

2021 m. Vasario 11 d. Brazilijos sveikatos apsaugos ministerijos vadovas Eduardo Pazuello paskelbė, kad ši padermė yra tris kartus labiau užkrečiama nei „originalus“ SARS-CoV-2.

  • Delta

2020 m. Spalio mėn. Linija B.1.617.2 pirmą kartą buvo aptikta Indijoje. Antroje 2021 m. Balandžio pusėje Indijos deltos padermė pateko į Rusiją.

2021 m. birželio 14 d. jis buvo aptiktas Indijojemutavęs variantas B.1.617.2, kuris žinomas kaip AY.1 arba „delta plius“ variantas. „Delta Plus“ išsiskiria tuo, kad smaigalio baltyme yra K417N mutacija, kuri gali sumažinti antikūnų aktyvumą pasveikusiems ir paskiepytiems žmonėms.

Indijos sveikatos ministerija įvardijo tris išskirtinius bruožus„delta plius“: padidėjęs užkrečiamumas, padidėjęs gebėjimas prisijungti prie plaučių ląstelių receptorių ir galimas atsparumas monokloninių antikūnų terapijai. 

Iki 2021 m. liepos pradžios Pasaulio organizacijaSveikatos priežiūros tarnybos užfiksavo delta padermę 98 šalyse, kuriose gyventojų skiepijimo lygis yra aukštas ir žemas, o daugelyje šalių ji tampa dominuojančia. 

Rusijos konsorciumo duomenimisSekvenuojant SARS-CoV-2 (Koronaviruso Rusijos genetinė iniciatyva, CoRGI) genomus, delta padermė užėmė šiek tiek daugiau nei pusę (52%) mėginių, gautų Sankt Peterburge 2021 m. Gegužės mėn., O 2021 m. Birželio mėn.-daugiau nei 90%.

Taip pat „delta pliusas“, nustatytas praėjusių metų birželį Nepale, priklauso grėsmių kategorijai. Jis turi penkias smaigalinio baltymo mutacijas, dėl kurių virusas yra labai pavojingas.

Kokias galimybes ieško COVID-19 mokslininkai

PSO sąraše yra dar keturi SARS-CoV-2 variantai, kurie domina, tačiau kol kas nėra jokios priežasties laikyti juos pavojingesniais: Eta, Iota, Kappa, Lambda.

  • Lambda

Pirmą kartą vadinamasis „lambda kamienas“ SARS-CoV-2praėjusios vasaros pabaigoje buvo skirta Peru. Taip pat buvo pranešta apie infekciją su naujuoju štamu Argentinoje ir Čilėje. Vėliau jis išplito į Vokietiją, Ispaniją, JAV, Didžiąją Britaniją ir keletą kitų šalių.

„Lambda padermės“ genome yra aštuoni rinkiniaipagrindinės mutacijos, kurios, kaip manoma, padidina viruso užkrečiamumą. Brazilijos mokslininkai, vadovaujami Priscila Wink iš Rio Grande do Sul federalinio universiteto, pirmą kartą užfiksavo SARS-CoV-2 „lambda varianto“ pėdsakus Brazilijoje ir atrado naują šios viruso versijos variantą. Padermė „lambda“ rasta liepos 19 d. 29 šalyse

  • Iota

Padermė buvo nustatyta praėjusių metų kovo mėnesį Niujorke,jis pasklido 35% greičiau. Kurį laiką sėkmingai konkuruodami su alfa, mokslininkai manė, kad kartu su spygliuoto baltymo E484K mutacija, padedančia išvengti antikūnų, ši galimybė būtų pavojinga. PSO jam paskyrė grėsmingą statusą. Tačiau šios prognozės nepasitvirtino, ir dabar jis tiesiog stebimas.

Ar vakcinos padės nuo naujų padermių?

Nėra aiškaus atsakymo. Vakcinų efektyvumą galima vertinti įvairiais būdais: 

  • Stebėkite, kaip keičiasi naujų atvejų skaičiusinfekcijos ir hospitalizavimas. Pavyzdžiui, Jungtinėje Karalystėje beveik 88% suaugusių gyventojų gavo vieną vakcinos dozę, 67% – antrąją. Šalyje dominuoja delta variantas. Remiantis oficialia statistika, per pastarąją savaitę sergamumas išaugo daugiau nei trečdaliu, o hospitalizacijų skaičius išaugo 46,8 proc.
  • Atlikite eksperimentą laboratorijoje. Mokslininkai sukuria pseudovirusą su smaigalio baltymu, prideda vieną po kitos mutaciją į jo genomą, imituodami tiriamą variantą. Tada jis sumaišomas su visiškai paskiepytų žmonių kraujo serumu ir lašinamas ant žmogaus ląstelių linijos, jautrios koronavirusui. Po kelių dienų užkrėstos ląstelės suskaičiuojamos.

Skaityti daugiau:

Paaiškino, kaip visata atsispindi šalia juodųjų skylių

Masinis apsinuodijimas ir naujos civilizacijos mirties versijos: kaip pasikeitė mūsų žinios apie majus

JAE išbando dirbtinio nusodinimo technologiją esant 50 laipsnių karščiui