Naujame darbe autoriai sukūrė neuroninį tinklą, kuris nustato, kokią formą įgaus konkretus baltymas.
Dabar baltymų forma apskaičiuojama naudojantdalelių greitintuvą, kuris pateikia trimatę baltymų molekulių fotografiją, arba su superkompiuterio pagalba, kuris apskaičiuoja jų struktūrą pagal chemijos ir kvantinės fizikos dėsnius.
Autoriai sukūrė evoformerio algoritmą, kurisbando nustatyti atskirų baltymų molekulių segmentų struktūrą, vaizduojant juos trimačio grafikų medžio pavidalu – matematinė abstrakcija, susidedanti iš objektų, sujungtų poromis vienas su kitu, rinkinio. Evoformer jungia juos tarpusavyje, remdamasis jau žinomais pavyzdžiais ir palaipsniui keičia jungčių struktūrą bei mazgų vietą, artėdamas prie optimalaus.
Tada jie sujungė tokius algoritmus ir sukūrė neuroninį tinklą AlphaFold2.
Pernai jau pristatėme pirmąją versijąmūsų sistema AlphaFold, kuri CASP13 konkurse galėjo nuspėti baltymų struktūrą beveik atominiu tikslumu. Dabar sukūrėme naują jos versiją, kuri savo greičiu ir tikslumu pastebimai lenkia visus konkurentus. Be to, jo šaltinio kodas yra visiškai atviras.
Demis Hassabis, „Deepmind“ generalinis direktorius
Dėl to neuronų tinklas atkuria trimatę formą atominiu tikslumu maždaug per 10 minučių, o kiekvienam baltymo viduje esančiam atomui paklaida yra 0,096 nanometrai.
Skaityti daugiau:
Paaiškino, kaip visata atsispindi šalia juodųjų skylių
Masinis apsinuodijimas ir naujos civilizacijos mirties versijos: kaip pasikeitė mūsų žinios apie majus
Žemės orbitos pokyčiai prisidėjo prie sudėtingos gyvybės atsiradimo planetoje