Nauja programinė įranga randa antibiotikams atsparių bakterijų, kurios užkrečia žmones ir gyvūnus

Naujame tyrime ekspertų komanda ištyrė didelį komercinį paukštyną Kinijoje ir surinko 154

gyvūnų, skerdenų, darbuotojų, jų augintinių mėginysūkiai ir aplinka. Iš mėginių išskyrė specifines bakterijas Escherichia coli (E. coli). Jos gali visiškai nekenksmingai gyventi žmogaus žarnyne, bet gali būti ir patogeniškos. Ir jei jų genomas turi atsparumo tam tikriems vaistams genus, tai gali sukelti rimtų ligų vystymąsi, įskaitant sunkius skrandžio spazmus, viduriavimą ir vėmimą.

Tyrėjai naudojo skaičiavimo metodąkuri apjungia mašininį mokymąsi, viso genomo sekos nustatymą, genų dalijimosi tinklus ir mobiliuosius genetinius elementus, kad apibūdintų skirtingus ūkyje aptinkamus patogenų tipus. Jie nustatė, kad antimikrobinių genų (genų, suteikiančių atsparumą antibiotikams) yra ir patogeninėse, ir nepatogeninėse bakterijose.

Naujas metodas naudojant mašininį mokymąsileido ekspertams atskleisti visą genų tinklą, susijusį su antimikrobiniu atsparumu, būdingu gyvūnams, ūkio darbuotojams ir aplinkai. Pažymėtina, kad šis tinklas apėmė genus, kurie, kaip žinoma, sukelia atsparumą antibiotikams, taip pat dar nežinomus genus, susijusius su atsparumu vaistams.

Sukurta aplinka, pvz., teritorijosintensyvi gyvulininkystė yra laikoma idealia terpe veistis antimikrobinėms medžiagoms atsparioms bakterijoms ir atsparumo antibiotikams genams. Jų tyrimas turi didelę reikšmę efektyviam tam tikrų ligų ir infekcijų gydymui.

Skaityti daugiau

Jis buvo medžiojamas šimtmečius: ką mes žinome apie Vulkano planetą šalia Saulės

Fizikai eksperimentiškai patvirtino naują pagrindinį skysčių dėsnį

Astronomai rado paslaptingų radijo bangų, sklindančių iš kosmoso, šaltinį